CCBR/LOGAN

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Stelle: 3
Fork: 6
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 19
Merge medio: 4m
PR unite (30g): 1

Lingua principale: Nextflow
Licenza: MIT
Ultimo push su GitHub: 8/9/2026
Ultima indicizzazione: 20/9/2026
Guida per i contributori: Guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Memory overallocation in process_somaticcaller_high Aperta

bug

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

CCBR/LOGAN#113 · Aperta il 27/2/2026
do not use global variables in modules Aperta

bug

CCBR/LOGAN#104 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 26/6/2025
octopus variant caller does not use available cores & memory Aperta

bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

CCBR/LOGAN#103 · 1 commento · Aperta il 26/6/2025
ensure reference genomes match renee Aperta

CCBR/LOGAN#94 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 16/5/2025
use nf-schema for parameter validation Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100

CCBR/LOGAN#93 · Aperta il 16/4/2025
Deepsomatic Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

CCBR/LOGAN#66 · Aperta il 21/11/2024
Build DV/Bcftools/GLnexus docker Aperta

bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

CCBR/LOGAN#63 · Aperta il 16/8/2024
Hg38 Genomes supported Aperta

bug

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

CCBR/LOGAN#59 · Aperta il 22/7/2024
Add Flowchart Aperta

bug

CCBR/LOGAN#57 · 1 assegnatario · Aperta il 19/7/2024
CRAM Compression Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

CCBR/LOGAN#35 · Aperta il 6/3/2024
validate variant calls with seqc2 consortium data Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

CCBR/LOGAN#33 · Aperta il 9/2/2024
create DAG from nextflow Aperta

CCBR/LOGAN#32 · 1 assegnatario · Aperta il 7/2/2024
support optional dragen processor on biowulf Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

CCBR/LOGAN#31 · 2 commenti · Aperta il 6/2/2024
compare tools for SNV, Indels, SV, EC-DNA vs GDC pipeline Aperta

CCBR/LOGAN#30 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 6/2/2024
Docker base Programs Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

CCBR/LOGAN#9 · 1 commento · Aperta il 24/10/2023
QC Improvements Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

CCBR/LOGAN#7 · Aperta il 18/10/2023
CNV/SV Caller Aperta

enhancement

CCBR/LOGAN#5 · 1 assegnatario · Aperta il 26/9/2023
GUI development Aperta

enhancement

CCBR/LOGAN#4 · 1 assegnatario · Aperta il 22/9/2023
Identify benchmarking data Aperta

enhancement

CCBR/LOGAN#3 · 1 assegnatario · Aperta il 22/9/2023

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