BlueBrain/Ultraliser

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Reconstruction of watertight meshes, annotated volumes and center line skeletons of neuroscience spatial structures from non-watertight inputs, segmented masks, skeletons of NGV morphologies and volumes.

Stelle: 36
Fork: 6
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 26

Lingua principale: C++
Licenza: GPL-3.0
Ultimo push su GitHub: 12/2/2024
Ultima indicizzazione: 14/9/2026
Guida per i contributori: Guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: help wanted
Metriche di merge delle PR: Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Compute distance from spine base to the soma Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#76 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 27/8/2024
Classification of arbors into axons and dendrites. Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#75 · 1 assegnatario · Aperta il 27/8/2024
Implement a binary PLY mesh reader and exporter. Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#71 · 1 assegnatario · Aperta il 12/4/2024
Split morphologies with multiple partitions into multiple objects Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#69 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 21/11/2023
Add a flag for conservative rasterization. Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#67 · 1 assegnatario · Aperta il 22/9/2023
Inquiries about Vessel Graph format for ultraVessMorpho2Mesh Aperta

help wanted

BlueBrain/Ultraliser#65 · 17 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 14/9/2023
Translatet the extracted morphology skeleton to the origin Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#63 · 1 assegnatario · Aperta il 6/9/2023
Adjusth the radii of the samples based on the skeletonization resolution Aperta

bug enhancement

BlueBrain/Ultraliser#61 · 1 assegnatario · Aperta il 6/9/2023
Compute the average estimates of the morphological measurements Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#59 · 1 assegnatario · Aperta il 5/9/2023
Implement a VMV5 format to load/export data file formats. Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#55 · 1 assegnatario · Aperta il 31/7/2023
Implement a WOBC functions for insertion and retrival from the volume Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#54 · 1 assegnatario · Aperta il 20/7/2023
ultraVolume2Mesh Aperta

bug

BlueBrain/Ultraliser#51 · 1 assegnatario · Aperta il 4/5/2023
Ultraliser::Mesh segfaults on destructor Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 45/100

BlueBrain/Ultraliser#50 · Aperta il 30/3/2023
Sparse voxel octree implementation Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#46 · 1 assegnatario · Aperta il 8/11/2022
Export resampled morphologies in SWC and H5 formats Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#44 · 1 assegnatario · Aperta il 29/9/2022
Tune auto parameters to create smooth neuronal meshes from morphologies. Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#41 · 1 assegnatario · Aperta il 24/8/2022
Detect surface curvature and increase the tessellation around Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

BlueBrain/Ultraliser#38 · Aperta il 5/8/2022
Calculation of Betti Number Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

BlueBrain/Ultraliser#34 · Aperta il 2/8/2022
Plotting script Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#33 · 1 assegnatario · Aperta il 2/8/2022
Adding Travis CI plan. Aperta

documentation enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100

BlueBrain/Ultraliser#28 · Aperta il 26/7/2022
Add support to load PPM masks in ultraMask2Mesh. Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#25 · 1 assegnatario · Aperta il 26/7/2022
Implement auto-mode to reconstruct an extremely smooth surface mesh from the morphologies Aperta

enhancement question

BlueBrain/Ultraliser#20 · 1 assegnatario · Aperta il 21/7/2022
Export Bit Volume to NRRD files in chunks Aperta

enhancement

BlueBrain/Ultraliser#18 · 1 assegnatario · Aperta il 20/7/2022
Segmentation fault during volume projection Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

BlueBrain/Ultraliser#15 · 1 commento · Aperta il 20/7/2022
Check the available memory before allocating the volumes Aperta

bug enhancement

BlueBrain/Ultraliser#14 · 1 assegnatario · Aperta il 15/7/2022
Handling meshes with husge sizes Aperta

bug enhancement

BlueBrain/Ultraliser#6 · 1 assegnatario · Aperta il 22/11/2021

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