mirbase.db is out of date and is likely to be deprecated
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 35/100
Direzione di ricerca
Inizia leggendo R/microRNAs.R per identificare come viene usato mirbase.db e quale comportamento dipende da esso. Decidi se la dipendenza debba essere rimossa o sostituita con dei mocks; il lavoro è completato quando il codice microRNA non dipende più dal mirbase.db obsoleto, mantenendo al contempo il comportamento eseguibile previsto.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
The use of mirbase.db in R/microRNAs.R is very nice and instructive
but mirbase.db has not been updated since a 2012 release and should
be dropped. Mocks can be produced to keep the code in microRNAs.R
running or the code can be eliminated.
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 26
- Fork
- 10
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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Bioconductor/GenomicFeatures#54 · 1 commento ·
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