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40 dépôts indexés · Voir sur GitHub

open-brain-consent
Making neuroimaging open from the grounds (consent form) and up (tools)

Shell · 45 étoiles
git-annex
A non-official testing bed and distribution of git-annex established for CON & DataLad purposes. Official git-annex repository: https://g...

Python · 29 étoiles
tributors
Pay tribute to your contributors! A tool to automatically update contributor files.

Python · 14 étoiles
yolo
Use podman to safely run claude-code with permission bypass (YOLO mode)

Shell · 14 étoiles
ference
(Idea stage) Open-source platform for virtual&hybrid conferencing

13 étoiles
duct
A helper to run a command, capture stdout/stderr and details about running

Python · 12 étoiles
tinuous
Download build logs and artifacts from GitHub Actions, Travis, and Appveyor

Python · 10 étoiles
nwb2bids
Reorganize NWB files into a BIDS directory layout.

Python · 5 étoiles
centerforopenneuroscience.org
Website materials

HTML · 4 étoiles
annextube
YouTube archive system using git-annex for efficient storage and incremental updates.

Python · 3 étoiles
citations-collector
Discover and curate scholarly citations of articles, datasets and software.

Python · 2 étoiles
catenate
All the resources and conText a new conScript needs, smushed together into a single doc.

2 étoiles
fscacher
Caching results of operations on heavy file trees

Python · 2 étoiles
skills
Anthropics claude-code skills for the CON masses

Python · 2 étoiles
communitator
RFC/idea: A Python module to assist contacting project's community

1 étoile
sparkle-tools

Python · 1 étoile
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A positive "con job"

1 étoile
shub
GitHub mirror of http://datasets.datalad.org/?dir=/shub providing historical copy of containers from https://singularity-hub.org

Python · 1 étoile
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Platform to discuss/distill coordination for validators output(s)

1 étoile
utils
Collection of utils from CON folks. Mostly quick&dirty helpers

Python · 1 étoile
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Ouverte Toutes

ReproNim AI @ MIT Oct 2026: STAMPED presentation Ouverte

con/cierge#48 · 1 personne assignée · Ouverte le 16/9/2026
play with mechababs run to gather performance Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

con/mechababs#161 · Ouverte le 16/9/2026
Remains non-trivial to get interactive backend for plotting going Ouverte

UX

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 68/100

con/duct#447 · 2 commentaires · Ouverte le 16/9/2026
Plots are never regenerated in CI: mtime cache is meaningless on a fresh checkout Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 64/100

con/duct-gallery#5 · Ouverte le 14/9/2026
COSYNE 2027: Submit abstract Ouverte

conference dandi ember

con/cierge#47 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 14/9/2026
use_cases.md: a story for `campaign init` at a superstudy that already carries campaigns Ouverte

automation

Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 92/100

con/mechababs#160 · Ouverte le 14/9/2026
`test_the_member_hint_appears_only_for_a_member` fails when the checkout path contains "superstudy" Ouverte

automation

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 88/100

con/mechababs#159 · Ouverte le 14/9/2026
e2e: assert a clean tree after every command Ouverte

automation

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 72/100

con/mechababs#158 · Ouverte le 14/9/2026
Yarik (+Cody) Dartmouth iEEG talk Ouverte

talk

con/cierge#46 · 2 personnes assignées · Ouverte le 14/9/2026
Improve Preview with some real videos (downscaled) Ouverte

con/annextube#32 · 1 personne assignée · Ouverte le 14/9/2026
Preflight git-annex and git on PATH at CLI entry, beside the venv check Ouverte

automation

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 72/100

con/mechababs#157 · Ouverte le 14/9/2026
Consider https://github.com/leej3/video-transcriber Ouverte

con/annextube#31 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 14/9/2026
Cross-session datasets: anat and func in different sessions defeat session-level selection and processing (ds001499, ds001506, ds004496, ds003020) Ouverte

dataset decision pipeline:fmriprep

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

con/mechababs#156 · 2 commentaires · Ouverte le 14/9/2026
fmriprep `DatasetLinks.raw` carries the per-job scratch abspath; should be the relative `sourcedata/raw` Ouverte

babs-upstream pipeline:fmriprep provenance upstream-NOT-FILED

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

con/mechababs#155 · Ouverte le 10/9/2026
Next steps Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

con/dev-centerforopenneuroscience.org#7 · Ouverte le 9/9/2026
ds004884: MRIQC QI2 gets NaN on a defaced T1w with zeroed air (nipreps/mriqc#1402) Ouverte

dataset pipeline:mriqc upstream

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 45/100

con/mechababs#153 · 2 commentaires · Ouverte le 9/9/2026
ds005752: MRIQC dies on a T2w with "inhomogeneity-corrected data seem empty" (nipreps/mriqc#1406) Ouverte

dataset pipeline:mriqc upstream

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

con/mechababs#152 · 1 commentaire · Ouverte le 9/9/2026
docs: evaluate a deploy token for subtree export Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

con/dev-centerforopenneuroscience.org#3 · Ouverte le 9/9/2026
`status` and `iterate` re-run `babs status` per active cell with no `--no-refresh` and no progress Ouverte

automation

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 68/100

con/mechababs#151 · Ouverte le 8/9/2026
Get dev-centerforopenneuroscience.org going Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100

con/dev-centerforopenneuroscience.org#1 · Ouverte le 8/9/2026
fMRIPrep: mris_expand aborts with a buffer overflow when the nipype workdir path is long (FreeSurfer) Ouverte

decision pipeline:fmriprep upstream

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

con/mechababs#150 · 5 commentaires · Ouverte le 4/9/2026
John talks about skills packaging/distribution Ouverte

con/cierge#45 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 4/9/2026
Consider APM for this repo Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

con/skills#10 · 1 commentaire · Ouverte le 4/9/2026
`run_uv` gives the `env_constraints` advice for a path/git-source build failure Ouverte

automation

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 82/100

con/mechababs#149 · Ouverte le 4/9/2026
A superstudy's members should be placeable under a subdirectory, not only at its root Ouverte

automation decision

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 50/100

con/mechababs#148 · Ouverte le 4/9/2026
e2e: the ReproNim/containers clone should be an optional cache, not a prerequisite Ouverte

automation

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

con/mechababs#147 · Ouverte le 4/9/2026
Drop the temporary datalad pin once a release carries datalad/datalad#7904 Ouverte

automation blocked upstream

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 52/100

con/mechababs#146 · 1 commentaire · Ouverte le 4/9/2026
`mechababs jobs` needs a `has_results` column Ouverte

automation

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 75/100

con/mechababs#145 · Ouverte le 4/9/2026
`merge` should save its own study-level facts so datalad's generic aux commit does not arise Ouverte

automation provenance

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 72/100

con/mechababs#144 · Ouverte le 4/9/2026
`drop-dataset`: there is no way to undo `add-dataset` Ouverte

automation decision

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 28/100

con/mechababs#143 · Ouverte le 4/9/2026
importfeed: wrong "from" annotation when feed has no title (regression in 10.20260901) Ouverte

ai-uncurated bug git-annex regression

Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 84/100

con/git-annex#291 · Ouverte le 4/9/2026
WebDAV remote hangs permanently after credential error (regression in 10.20260901) Ouverte

ai-uncurated bug git-annex regression severity-important

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 72/100

con/git-annex#290 · Ouverte le 4/9/2026
Introduce AI related annotations to /introduce-reuse-compliance Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

con/skills#8 · Ouverte le 3/9/2026
Add eval-under-virtiofs Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 38/100

con/eval-under#9 · Ouverte le 31/8/2026
Add running some basic sqlite3 tests Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 55/100

con/eval-under#8 · Ouverte le 31/8/2026
US RSE 2026: poster "Agent-friendly Provenance Capture with `con-duct`" Ouverte

con/cierge#44 · 1 personne assignée · Ouverte le 28/8/2026
US RSE 2026: poster "Beyond the Lab Website: Reusing Structured Research Metadata Across Lab Operations" Ouverte

con/cierge#43 · 2 personnes assignées · Ouverte le 28/8/2026
US RSE 2026: poster "STAMPED in Practice: Reproducing a Scientific Result Using ABCD Neuroimaging Data" Ouverte

con/cierge#42 · 1 personne assignée · Ouverte le 28/8/2026
Retire $JOB_TMP: the container /tmp bind should not need a cluster-axis variable Ouverte

automation generalize

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

con/mechababs#125 · 3 commentaires · Ouverte le 26/8/2026
mechababs aggregate Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 28/100

con/mechababs#123 · Ouverte le 24/8/2026
Simplify `Run datalad tests` step — `-c $toxini` no longer needed for datalad's pytest config Ouverte

Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 55/100

con/git-annex#289 · Ouverte le 24/8/2026
`git annex test` still fails on BeeGFS: `renamePath ... resource busy` in the export tests Ouverte

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 48/100

con/git-annex#288 · Ouverte le 22/8/2026
Mark known to be failing matrix runs as xfails and avoid announcing them Ouverte

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

con/eval-under#4 · Ouverte le 21/8/2026
Growing a campaign's app bundle mid-campaign — deferred by design Ouverte

fuzzy/slop

Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

con/mechababs#116 · Ouverte le 21/8/2026
Publish mechababs to PyPI Ouverte

automation

Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 55/100

con/mechababs#113 · Ouverte le 20/8/2026
Store CLI invocation used to produce yolo image within yolo image Ouverte

con/yolo#77 · 1 réaction · 2 personnes assignées · Ouverte le 20/8/2026
Sfn 2026: Brain Initiative Toolmakers? Ouverte

brain initiative conference

con/cierge#41 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 19/8/2026
OHBM 2027 Ouverte

conference

con/cierge#40 · 1 commentaire · 1 personne assignée · Ouverte le 19/8/2026
US RSE 2026: CON talk slides Ouverte

con/cierge#39 · 1 personne assignée · Ouverte le 17/8/2026
US RSE 2026: CON talk final'camera ready' title/athors/abstract Ouverte

con/cierge#38 · 1 personne assignée · Ouverte le 17/8/2026

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