INCATools/ubergraph

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Integrated OBO ontology store

INCATools/ubergraph est-il accessible aux débutants ?

Nous avons vu trop peu de pull requests récentes de contributeurs externes sur INCATools/ubergraph pour dire à quelle fréquence elles sont fusionnées. Aucune issue accessible aux débutants n'est ouverte pour l'instant ; la liste ci-dessous montre les autres issues que nous avons pour ce dépôt.

Étoiles
53
Forks
5
Issues débutants ouvertes
0
Issues indexées
34
Merge moyen
1 min
PR mergées (30 j)
1
Langage dominant
Makefile
Licence
BSD-3-Clause
Dernier push GitHub
2/10/2026
Dernière indexation
17/9/2026
Aucun guide de contribution
Aucun code de conduite
Labels débutants
Aucun label débutant indexé

Comment contribuer à INCATools/ubergraph

  1. Il n'y a pas de guide de contribution : partez du README et de quelques pull requests fusionnées récemment pour voir comment les changements sont proposés.
  2. Il fournit un Dockerfile ou un fichier Docker Compose, vous pouvez donc le lancer sans installer toute sa chaîne d'outils.
  3. Vos contributions seront publiées sous la licence BSD-3-Clause du projet.
  4. Suivez le dépôt pour savoir quand une nouvelle issue accessible aux débutants s'ouvre, ou parcourez les autres issues ci-dessous.
Accessible aux débutants Tout
Ouverte Toutes

Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date

  • Extend UI to support a curie-curie view to help with Translator provenance
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 30/100

    INCATools/ubergraph#177 ·

  • Provenance?
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 35/100

    INCATools/ubergraph#174 · 1 commentaire ·

  • Add text embedding vectors
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    INCATools/ubergraph#168 ·

  • Add Upheno
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#163 · 2 commentaires ·

  • add FBbt to coherency check
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100

    INCATools/ubergraph#161 ·

  • Ensure docker file matches the actually used image
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 45/100

    INCATools/ubergraph#159 ·

  • Weirdness in Ubergraph around RO and BFO labels (two labels for one CURIE)
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    INCATools/ubergraph#156 · 1 commentaire ·

  • Is there a place for sharing/storing SPARQL queries on the Ubergraph?
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#148 ·

  • Update Biolink version
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    INCATools/ubergraph#145 ·

  • cell_by_type_location_species.rq should come with a health warning
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    INCATools/ubergraph#142 · 1 personne assignée ·

  • Add simple subsumption GLRC query
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#141 ·

  • Add GRLC query that restricts anatomy by subset as well as location
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#140 ·

  • Add GRLC query that restricts cell type by subset as well as location
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    INCATools/ubergraph#139 ·

  • New GRLC queries to add
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#138 ·

  • Add Allen Brain Atlas ontologies (with bridges)
    Peut-être à nouveau libre Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    INCATools/ubergraph#137 · 2 commentaires · 2 personnes assignées ·

  • Add some obo-db-ingests into ubergraph (EC, RHEA, SwissLipid)
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 28/100

    INCATools/ubergraph#134 · 1 commentaire ·

  • HAO base procedure is removing depiction individuals
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

    INCATools/ubergraph#124 ·

  • A few ontologies have stray dc:descriptions
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#121 · 2 commentaires ·

  • adding knowledge graph links with different semantics
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    question

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 20/100

    INCATools/ubergraph#117 · 3 commentaires ·

  • 'mature T cell' has direct superclass 'material entity'
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#105 ·

  • Ensure nonredundant doesn't have subClassOf cycles
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

    INCATools/ubergraph#104 ·

  • eliminate OBO hash IRIs
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#102 · 6 commentaires · 1 réaction ·

  • add ExO
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

    INCATools/ubergraph#93 ·

  • Use ELK 0.5+ in coherency check
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    INCATools/ubergraph#78 · 1 commentaire ·

  • add issue generation to coherency check
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#75 · 1 commentaire ·

  • obsolete URL at sparqlfun
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 30/100

    INCATools/ubergraph#73 · 1 réaction ·

  • QC of new Ubergraph builds
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#33 · 1 commentaire ·

  • Add DO
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#20 · 1 commentaire ·

  • Provide downloadable artifacts
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#19 · 1 commentaire ·

  • normalize all rdfs:label values when loading
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#15 ·

  • describe which entailment regime is used
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    INCATools/ubergraph#13 ·

  • Add instructions on how to set up an ubergraph instance with a custom set of ontologies
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

    INCATools/ubergraph#12 · 7 commentaires ·

  • Add CHIRO ontology
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 10/100

    INCATools/ubergraph#9 ·

  • Add bridges from Uberon/CL to Taxon-specific ontologies
    Peut-être pris Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    INCATools/ubergraph#136 · 1 personne assignée ·

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