Support selected flexible receptor residues in the Vina adapter
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 55/100
Línea de trabajo
Start with devguide/pending_proposals/support_selected_flexible_receptor_residues_in_the_vina_adapter.md, then locate the current Python Vina adapter and its MolSysMT projection calls. Trace how rigid receptor data, residue-to-pose mapping, and protocol provenance are handled. Done means selected flexible residues produce paired rigid/flexible PDBQT inputs accepted by Vina while preserving the requested mapping and provenance.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
What — Run a Vina protocol with explicitly selected flexible receptor residues.
How — Request paired rigid/flexible PDBQT projections from MolSysMT, pass both to Vina, and retain residue-to-pose mapping and protocol provenance.
Why — Vina supports a separate flexible receptor file, while the current adapter advertises rigid receptor only.
Record — devguide/pending_proposals/support_selected_flexible_receptor_residues_in_the_vina_adapter.md
Related — uibcdf/dockingmt#3
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 1
- Forks
- 0
- Merge medio
- 30 min
- PR fusionados (30 d)
- 1
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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