Invalid "selection" values in "read_zarr()" should raise an error
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Evaluación
- Dificultad
- 2/5
- Tiempo estimado
- 1-3 horas
- Aptitud para principiantes
- 78/100
Línea de trabajo
Comienza en el punto de entrada spatialdata.read_zarr() e inspecciona cómo se gestiona el argumento selection. Valida las entradas con images, labels, points, shapes y tables, y confirma que un valor desconocido como "table" produzca un ValueError claro en lugar de omitir datos silenciosamente.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
spatialdata.read_zarr() currently appears to silently ignore invalid values passed to selection.
For example:
sdata = spatialdata.read_zarr(
path,
selection=("table",),
)
returns a SpatialData object with no loaded tables instead of indicating that "table" is not a valid selector.
It would be safer if read_zarr() validated selection against the supported values:
{"images", "labels", "points", "shapes", "tables"}
and raised a clear ValueError for unknown entries. Silent failure can otherwise make a valid Zarr store look empty and is difficult to diagnose.
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 399
- Forks
- 100
- Merge medio
- 1 d 1 h
- PR fusionados (30 d)
- 3
Preparar el entorno
- Incluye un Dockerfile o un archivo de Docker Compose
- Sin plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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