Exclude Argument in getCandidateCodes Excludes Partial Matches Instead of Exact Terms
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Evaluación
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Aptitud para principiantes
- 35/100
Línea de trabajo
Localiza la función getCandidateCodes y reproduce el ejemplo de depresión reportado usando el argumento exclude. Rastrea cómo se comparan los términos de exclusión y, después, actualiza el comportamiento para que un término exacto como "ST depression" no elimine códigos que solo contienen "depression"; añade o actualiza pruebas que demuestren ambos casos.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
The "exclude" argument in the getCandidateCodes function excludes all codes that contain the specified character vectors. However, I believe it would be more useful if it excluded only the exact words or character sequences specified.
For example, when phenotyping depression, I included codes containing the words "depression" or "depressive" and their descendants. However, some codes such as "ST depression" (referring to ECG changes and not the mental health condition) were also included. When I specified "ST depression" in the exclude argument, all codes containing the word "depression" were excluded, excluding the main codes relevant for the depression phenotype.
Thanks!
- Lenguaje dominante
- R
- Estrellas
- 18
- Forks
- 9
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Sin plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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