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R package for fetching and parsing data of the Human Microbiome Compendium

Estrellas: 17
Forks: 3
Issues abiertos para principiantes: 1
Issues indexados: 19

Lenguaje dominante: R
Licencia: Sin datos de licencia
Último push a GitHub: 24/1/2025
Última indexación: 14/9/2026
Guía de contribución: Sin guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas
Métricas de merge de PR: Sin PR fusionados en 30 d

Para principiantes Todo

Abierto Todos

Generate (and log) seed for rarefaction step Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#33 · 1 asignado · Abierto el 5/5/2026
Retrieve projection library from zenodo Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#31 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 21/4/2026
Add projection web app documentation Abierto

documentation

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 58/100

blekhmanlab/MicroBioMap#30 · Abierto el 17/4/2026
Document custom ordination process Abierto

documentation

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 68/100

blekhmanlab/MicroBioMap#29 · Abierto el 17/4/2026
Add projection recipes Abierto

documentation

blekhmanlab/MicroBioMap#27 · 1 asignado · Abierto el 16/4/2026
Add projection to vignette Abierto

documentation

Dificultad 2/5 Medio día Aptitud para principiantes 45/100

blekhmanlab/MicroBioMap#26 · 1 comentario · Abierto el 16/4/2026
Prep release of projection code Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#25 · 1 asignado · Abierto el 16/4/2026
Examples of generating maps Abierto

documentation

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

blekhmanlab/MicroBioMap#28 · Abierto el 17/3/2026
Define ordinations from custom taxon weights Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#24 · 1 asignado · Abierto el 19/2/2026
Define ordinations from custom subset of compendium Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#23 · 1 asignado · Abierto el 19/2/2026
Project user data using pre-calculated ordinarions Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#22 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 19/2/2026
taxanomy information at strain level Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

blekhmanlab/MicroBioMap#16 · 6 comentarios · 1 reacción · Abierto el 18/2/2024
Clean up non-idiomatic code in vignette Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

blekhmanlab/MicroBioMap#14 · Abierto el 21/10/2023
Taxonomic levels Genus names at Family rank Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

blekhmanlab/MicroBioMap#13 · 1 comentario · Abierto el 16/10/2023
Include "recipes" in vignette Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

blekhmanlab/MicroBioMap#12 · 1 comentario · Abierto el 29/8/2023
Map organisms to Greengenes2 Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#10 · 1 asignado · Abierto el 4/8/2023
Provide link for studies in compendium in BugSigDB Abierto

blekhmanlab/MicroBioMap#9 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 4/8/2023
Co-occurrence visualization Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

blekhmanlab/MicroBioMap#7 · Abierto el 1/8/2023
Background text for pipeline Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

blekhmanlab/MicroBioMap#6 · Abierto el 1/8/2023

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