biocore/mmvec

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• Missing file in output folder of mmvec paired-omics command

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

  biocore/mmvec#183 · 9 comentarios · Abierto el 21/11/2024

• Multiple group comparisons within one sole mmvec analysis

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  biocore/mmvec#182 · 3 comentarios · Abierto el 21/11/2024

• visualization the result of mmvec

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  biocore/mmvec#181 · 1 comentario · Abierto el 8/9/2024

• Tensorflow-gpu is not found upon installation

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  biocore/mmvec#177 · 1 comentario · Abierto el 7/12/2023

• Compatibility issues on macbook pro with M1 chip

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  biocore/mmvec#175 · 4 comentarios · Abierto el 26/7/2023

• Plugin error from mmvec: index 0 is out of bounds for axis 0 with size 0

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  biocore/mmvec#170 · Abierto el 15/6/2022

• MMvec refactor

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

  biocore/mmvec#166 · 6 comentarios · 1 reacción · Abierto el 22/3/2022

• Tips and Tricks to speed up training

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 35/100

  biocore/mmvec#165 · Abierto el 8/3/2022

• Upgrade pandas

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  biocore/mmvec#145 · Abierto el 1/9/2020

• Tensorboard only shows a single point

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  biocore/mmvec#144 · 1 reacción · Abierto el 13/8/2020

• mmvec metagenomic full abundance table or sub-selected table

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  biocore/mmvec#136 · 1 comentario · Abierto el 21/6/2020

• Throw error when iterations is too small

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  biocore/mmvec#129 · Abierto el 29/3/2020

• BUG: paired-heatmap keep_top_samples option is broken

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  biocore/mmvec#121 · 1 reacción · Abierto el 7/2/2020

• Update min-feature-count argument

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 38/100

  biocore/mmvec#113 · Abierto el 11/12/2019

• Simplify delivery and interfacing

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  bug

  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

  biocore/mmvec#111 · 5 comentarios · Abierto el 10/12/2019

• Raise error when passing in wrong files

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  biocore/mmvec#109 · Abierto el 21/11/2019

• bug: paired-heatmap top-k-microbes fails when top microbes are not found in ranks

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 42/100

  biocore/mmvec#108 · Abierto el 20/11/2019

• Adding --p-logging-dir option

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  biocore/mmvec#101 · Abierto el 21/10/2019

• Need warning for cross validation

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  biocore/mmvec#96 · Abierto el 5/10/2019

• Make filtering consistent between tables

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  biocore/mmvec#95 · Abierto el 3/10/2019

• Enable simple hypothesis tests

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  biocore/mmvec#94 · Abierto el 2/10/2019

• Clean up branches

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  Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 45/100

  biocore/mmvec#87 · Abierto el 10/9/2019

• Update qiime2/GNPS tutorials

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  biocore/mmvec#83 · Abierto el 3/9/2019

• Version 1 action items

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  biocore/mmvec#81 · Abierto el 3/9/2019

• Error running on GPU: device renaming issue?

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  biocore/mmvec#79 · 2 comentarios · Abierto el 28/8/2019

• Better summaries

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  biocore/mmvec#77 · Abierto el 26/8/2019

• Linked scatter plots through vega?

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  biocore/mmvec#76 · 4 comentarios · Abierto el 22/8/2019

• Nailing down terminology

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  question

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  biocore/mmvec#74 · 2 comentarios · Abierto el 21/8/2019

• Docker containers for Rhapsody

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  biocore/mmvec#73 · Abierto el 19/8/2019

• GPU Memory Allocation Limits

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  biocore/mmvec#67 · 2 comentarios · 1 reacción · Abierto el 25/7/2019

• Early stopping

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  enhancement good first issue help wanted

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  biocore/mmvec#59 · Abierto el 23/6/2019

• Ordination results as a separate command

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  biocore/mmvec#56 · Abierto el 13/6/2019

• naming summary directories

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  biocore/mmvec#55 · Abierto el 13/6/2019

• scramble input

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  biocore/mmvec#54 · Abierto el 13/6/2019

• train/test split is inefficient

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  biocore/mmvec#44 · 4 comentarios · Abierto el 10/5/2019

• Automatic hyperparameter tuning

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  biocore/mmvec#42 · Abierto el 10/5/2019

• Upcoming commands

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  biocore/mmvec#41 · 1 comentario · Abierto el 1/5/2019

• Switch to pytorch

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  biocore/mmvec#40 · 1 comentario · Abierto el 29/4/2019

• Simplify the standalone CLI interface

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  biocore/mmvec#32 · Abierto el 9/4/2019

• Low level optimizations

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  biocore/mmvec#22 · Abierto el 26/2/2019

• Parameter recovery tutorial

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  biocore/mmvec#19 · Abierto el 11/2/2019

• better defaults

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  biocore/mmvec#15 · Abierto el 21/10/2018

• Switch to pytests

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  biocore/mmvec#11 · Abierto el 24/9/2018