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• Windows pip install fail: UnicodeDecodeError: 'charmap' codec can't decode byte

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 55/100

  biocore/empress#572 · 1 comentario · Abierto el 23/9/2026

• Joint-RPCA biplot axis 1 is 100%

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  biocore/gemelli#119 · 1 comentario · Abierto el 17/9/2026

• Any plans on dependency updates for aarch64 builds

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  biocore/deblur#222 · 4 comentarios · Abierto el 31/8/2026

• empress and rachis-qiime2-2026.7

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 45/100

  biocore/empress#571 · 2 comentarios · Abierto el 28/8/2026

• Add support for python 3.13 and 3.14

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  biocore/improved-octo-waddle#63 · 1 comentario · Abierto el 26/8/2026

• GPU not used in test_su and test_ska

  Quizá libre de nuevo @sfiligoi la tomó hace 51 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  biocore/unifrac-binaries#91 · 1 asignado · Abierto el 7/8/2026

• GPU PERMANOVA reads an uninitialized pseudo-F: device buffer sized n_perm, kernel launched over n_perm+1

  Quizá libre de nuevo @sfiligoi la tomó hace 54 días y no hay ningún pull request abierto. Abierto

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  biocore/unifrac-binaries#89 · 1 asignado · Abierto el 4/8/2026

• Question about native Windows support for Gemelli joint-RPCA

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  Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

  biocore/gemelli#116 · 1 comentario · Abierto el 25/6/2026

• Species labels assigned in the backbone 16S references

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  biocore/greengenes2#16 · 5 comentarios · Abierto el 8/6/2026

• Numpy 2.4: in1d replaced by isin

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  biocore/biom-format#1003 · Abierto el 18/5/2026

• `to_dataframe` behaves differently with Pandas 3.0

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  biocore/biom-format#1001 · Abierto el 24/2/2026

• Incorrect results on example data?

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  biocore/tax2tree#47 · 10 comentarios · Abierto el 19/2/2026

• WOLr2 updated metadata file?

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  biocore/zebra_filter#17 · Abierto el 10/2/2026

• GG2 2024.09 update

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  biocore/q2-greengenes2#31 · 1 comentario · Abierto el 4/2/2026

• Replicate processing gives 4 preps (due to demux_sample_sheet behavior)

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

  biocore/kl-metapool#363 · 2 comentarios · Abierto el 29/1/2026

• qiime2-amplicon-2025.7 module 'skbio.diversity.alpha' has no attribute 'sobs' error

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  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

  biocore/empress#570 · 1 comentario · Abierto el 9/1/2026

• Implement local/CI stable test of iseqnormpool picklist contents for metaT notebook

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  biocore/kl-metapool#354 · Abierto el 7/1/2026

• Improve validity checks when loading BIOM file

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  biocore/unifrac-binaries#84 · 1 reacción · Abierto el 22/12/2025

• Update notebook extension installation method.

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  Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

  biocore/emperor#827 · Abierto el 13/12/2025

• int32 for indices/indptr

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  biocore/biom-format#999 · 1 comentario · Abierto el 26/11/2025

• Refactor to remove duplicated sample_name to sample_id scrubbing logic

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  biocore/kl-metapool#344 · Abierto el 5/11/2025

• scikit-bio conflict

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  biocore/q2-greengenes2#30 · 1 comentario · Abierto el 5/11/2025

• Fix dependence on Illumina (only) file name format to determine sample name

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  biocore/kl-metapool#341 · Abierto el 3/11/2025

• Write tests for/add NaN handling of dataframe input case of `metapool.format_pooling_echo_pick_list()`

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  Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

  biocore/kl-metapool#340 · Abierto el 1/11/2025

• Invalid certificate

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  biocore/biom-format#998 · 1 comentario · Abierto el 27/10/2025

• Update vega schema to v6

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  biocore/emperor#825 · Abierto el 22/10/2025

• DuckDB calls to .pl() might be able to include lazy=True

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  biocore/micov#44 · Abierto el 8/10/2025

• `nonqiita_to_parquet` does not need to preserve insertion order

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  biocore/micov#43 · 1 comentario · Abierto el 29/9/2025

• Compression of multiple coordinate files breaks due to header

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  biocore/micov#42 · Abierto el 28/9/2025

• Polars version incompatibility with older CPUs

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  biocore/micov#41 · Abierto el 15/9/2025

• Refactor scripts (seqpro, seqpro_mf) and supporting classes into qp-klp

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  biocore/kl-metapool#335 · Abierto el 10/9/2025

• Add replicate support for metatranscriptomics

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  biocore/kl-metapool#324 · Abierto el 27/8/2025

• neg_binomial_2_log_lpmf: Precision parameter is 0, Even After Changing Prior

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  biocore/BIRDMAn#102 · 2 comentarios · Abierto el 5/8/2025

• Centralize manipulation of de-replicated dataframe to PlateReplication

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  enhancement

  Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

  biocore/kl-metapool#321 · Abierto el 1/8/2025

• Usage of `pynose` instead of `nose3` for the nosetests

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  biocore/improved-octo-waddle#62 · Abierto el 16/7/2025

• Songbird - Qiime2 compatibility

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  biocore/songbird#172 · Abierto el 8/7/2025

• Missing required sample sheet columns are filled in blank without triggering an error

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  biocore/kl-metapool#305 · 1 comentario · Abierto el 13/6/2025

• Duplication of sample sheet field names in prep module

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  biocore/kl-metapool#303 · Abierto el 13/6/2025

• Some issuses

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  biocore/gemelli#112 · Abierto el 2/6/2025

• qiime2 plugin does not support RelativeFrequency ?

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  biocore/unifrac#168 · Abierto el 14/5/2025

• raise warning for seq depth issue

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  biocore/gemelli#111 · Abierto el 12/5/2025

• Understanding gemmeli's changes to a phylogenetic tree within phylo-CTF

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  biocore/gemelli#110 · 5 comentarios · Abierto el 28/4/2025

• Nan on two identical samples

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  biocore/unifrac-binaries#70 · 1 comentario · Abierto el 15/4/2025

• Consolidate files to be either txt or csv.

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  biocore/kl-metapool#285 · Abierto el 3/4/2025

• Potential Daklapack Order Loss

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  biocore/microsetta-private-api#604 · 1 comentario · Abierto el 11/3/2025

• Resource punkt_tab not found.

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  biocore/redbiom#131 · 2 comentarios · Abierto el 6/3/2025

• Missing E.coli from GG2, or is called something else now?

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  biocore/q2-greengenes2#29 · 6 comentarios · Abierto el 6/3/2025

• Installation incompatibilities

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  biocore/deblur#220 · 2 comentarios · Abierto el 5/3/2025

• min_sample_depth uses exclusive threshhold, unlike other qiime2 plugins

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  biocore/gemelli#109 · Abierto el 19/2/2025

• Option to write out the filtered features for troubleshooting

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  biocore/greengenes2#13 · 2 comentarios · Abierto el 13/2/2025