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Issue with vertcross function when using Fortran-order data from .npy files

Abierto
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Evaluación

Dificultad
3/5
Tiempo estimado
1-2 días
Aptitud para principiantes
38/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
numpy, python
Área
data

Línea de trabajo

Comienza en el punto de entrada de vertcross y reproduce el ValueError informado con datos en orden Fortran cargados mediante np.load. Compara ese comportamiento con np.ascontiguousarray(vorticity); se considera terminado cuando vertcross gestiona correctamente la entrada o documenta y comunica claramente su requisito sobre el orden de los datos.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

I encountered an issue when using the vertcross function from the wrf-python package to perform vertical interpolation on data stored in a .npy file. Specifically, when I load the .npy file , the data is stored in Fortran-order (column-major) format by default.

The vertcross function seems to require C-order (row-major) data storage format to work correctly. When passing Fortran-order data, I received a ValueError: invalid shape for argument 1 (got (38,), expected (360,)), which suggests a misinterpretation of the data shape due to the storage format mismatch.

Steps to Reproduce:
  1. Load vorticity data counted by wrfout (e.g., vorticity) from a .npy file:

    vorticity = np.load("vorticity.npy")
    
  2. Attempt to use vertcross to perform vertical interpolation:

    vs_cross = vertcross(vorticity, z, ...)
    
  3. Encounter the error: ValueError: invalid shape for argument 1 (got (38,), expected (360,))
    The vertcross function should work correctly when the data is in Fortran-order (which is the default when reading .npy files). If the function requires C-order, it would be helpful to include a clear message in the documentation or provide an automatic conversion inside the function.

solution:

Manually converting the data to C-order format using np.ascontiguousarray() resolves the issue:

vorticity = np.ascontiguousarray(vorticity)
vs_cross = vertcross(vorticity, z, ...)

It would be helpful if the vertcross function could automatically handle Fortran-order data or provide better error handling or documentation related to data format expectations.

Lenguaje dominante
Python
Estrellas
498
Forks
178
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

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