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wrsamp: IndexError: Channel 0 contains values outside the allowed range [-32768, 32767] for fmt 16

Abierto
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Evaluación

Dificultad
4/5
Tiempo estimado
3-5 días
Aptitud para principiantes
25/100
Tipo de issue
Error
Claridad
Necesita aclaración
Estado de actividad
Estancado
Stack tecnológico
python
Área
data

Línea de trabajo

Empieza reproduciendo la llamada a wrsamp con el rango de entrada indicado e inspecciona cómo se escalan los valores para fmt 16 antes de la comprobación de rango. El payload no nombra archivos fuente ni pruebas; se considera terminado cuando los datos descritos se puedan escribir sin producir valores fuera del rango permitido de fmt 16, con cobertura de regresión para el caso.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

We're encountering an issue when trying to write data to WFDB files using the wrsamp function. Specifically, we’re seeing an error that prevents us from writing the files correctly. When attempting to call wrsamp to save our data, we receive the following error message:

IndexError: Channel 0 contains values outside the allowed range [-32768, 32767] for fmt 16.

To investigate the issue further, we modified the WFDB source code to provide additional debugging information. The csv file we’re attempting to convert to wfdb has values ranging between:

Minimum: -90.113269
Maximum: 622.269327

But this is being scaled to -32767 and 32772 after calling wrsamp, so the max value allowed in fmt 16 is being exceeded.

We are using package versions:

Please see a screenshot below depicting the error we get using:
wfdb==4.1.2
pandas==2.2.3
numpy==2.1.2
image001

We have a minimal reproducible sample that we sent to Ben Moody and Tom Pollard.

Lenguaje dominante
Jupyter Notebook
Estrellas
853
Forks
323
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Preparar el entorno

Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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