Make `to_numpy` conversions consistent with NumPy `dtype`
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 35/100
Línea de trabajo
Comienza con la implementación vinculada de to_numpy() en src/JlWrap/array.jl y compara después su tratamiento de los vectores anidados con los ejemplos de NumPy del issue. La tarea estará terminada cuando los arrays de enteros anidados produzcan valores de dtype coherentes con NumPy, incluidos los casos bidimensional y tridimensional descritos aquí.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Moved discussion in #462 into this separate issue.
Other PythonCall issues related to NumPy dtype and Numpy arrays that may be relevant:
- #319
- #439
- #441
- #486
My system details (click to expand)
Julia
julia> versioninfo()
Julia Version 1.12.1
Commit ba1e628ee49 (2025-10-17 13:02 UTC)
Build Info:
Official https://julialang.org release
Platform Info:
OS: Linux (x86_64-linux-gnu)
CPU: 48 × AMD EPYC 7V13 64-Core Processor
WORD_SIZE: 64
LLVM: libLLVM-18.1.7 (ORCJIT, znver3)
GC: Built with stock GC
Threads: 1 default, 1 interactive, 1 GC (on 48 virtual cores)
julia> Pkg.status()
Status `~/temp/Project.toml`
[992eb4ea] CondaPkg v0.2.33
[6099a3de] PythonCall v0.9.28
Python Environment
- python 3.13.9
- numpy 2.3.4
I noticed a difference in how the PythonCall to_numpy() function and NumPy treat property values of dtype as follows:
julia> using PythonCall
julia> Py(rand(10)).to_numpy().dtype
Python: dtype('float64')
julia> Py([[1,2,3], [4,5,6]]).to_numpy().dtype
Python: dtype('O')
I would expect the latter to be dtype('int64') to match Python:
>>> import numpy
>>> a = numpy.array([[1,2,3], [4,5,6]])
>>> a.dtype
dtype('int64')
While Julia does provide Matrix{Int64} and to_numpy() outputs dtype('int64') as I would expect
julia> [1 2 3; 4 5 6] |> typeof
Matrix{Int64} (alias for Array{Int64, 2})
julia> Py([1 2 3; 4 5 6]).to_numpy().dtype
Python: dtype('int64')
I am working on a project where I need to use PythonCall to deal with Vector{Vector{Int64}} instances and changing into Matrix{Int64} is not an option.
In Julia, using PythonCall to_numpy(), it is clear that dtype('int64') is only output for Vector{Int64} not Vector{Vector{Int64}} nor Vector{Vector{Vector{Int64}}} regardless of how many levels of nesting:
julia> Py([1, 2, 3]).to_numpy().dtype
Python: dtype('int64')
julia> Py([[1,2,3], [4,5,6]]).to_numpy().dtype
Python: dtype('O')
julia> Py([[[1,2,3], [4,5,6]], [[7,8,9], [10,11,12]]]).to_numpy().dtype
Python: dtype('O')
Whereas in Python, dtype('int64') is output for all the above:
>>> numpy.array([1, 2, 3]).dtype
dtype('int64')
>>> numpy.array([[1,2,3], [4,5,6]]).dtype
dtype('int64')
>>> numpy.array([[[1,2,3], [4,5,6]], [[7,8,9], [10,11,12]]]).dtype
dtype('int64')
Thus the value of the property .dtype in NumPy is defined based on the innermost elements in the array, whereas in Julia the value of .dtype upon using to_numpy() is not based on the innermost elements (i.e. 1, 2, 3, etc) but on the whole structure containing them (i.e Vector{Int64} for the 2nd array, and Vector{Vector{Int64}} for the 3rd array).
I was expecting the same behaviour from Python's NumPy and the conversions from to_numpy() given by PythonCall, but it turns out the conversion does not agree with NumPy on dtype property values.
- Lenguaje dominante
- Julia
- Estrellas
- 1.1k
- Forks
- 89
- Merge medio
- 1 d 22 h
- PR fusionados (30 d)
- 5
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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