qpGraph showing worst f statistic with repeated populations
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 20/100
- Tipo de issue
- Error
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- c
- Área
- bioinformatics
Línea de trabajo
El informe se refiere a una salida de qpGraph y a un resultado de qpDstat, con un grafo adjunto, pero sin archivos ni pruebas especificados. Comienza reproduciendo el resultado de qpGraph indicado y comparando las estadísticas f de la población repetida con el resultado de qpDstat descrito. Se considera terminado cuando se determine si esta salida es esperada o se identifique una discrepancia reproducible.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Dear Nick,
I'm trying to work out a model with complex admixtures starting with a simple one and adding nodes. My starting point was based on a D calculation that wasn't significant, using qpDstat. But when I plot the qpGraph, I get f statistics with repeated populations. Is this normal behaviour?
I'm attaching the qpGraph below.
Many thanks in advance
- Lenguaje dominante
- C
- Estrellas
- 236
- Forks
- 76
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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