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Inquiries about Vessel Graph format for ultraVessMorpho2Mesh

Abierto
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@marwan-abdellah ya está trabajando en esto.

Desde el 21/9/2023.

Evaluación

Este issue todavía no se ha evaluado.

Descripción

help wanted

Hi,

Thanks for the amazing work. I am trying to build mesh out of vessel skeletons. I have been reading the wiki page to prepare the input from numpy arrays,

https://github.com/BlueBrain/Ultraliser/wiki/Examples-ultraVessMorpho2Mesh

I noticed that there is only a link to .SWC format. Could you please also explain how I can prepare VMV and H5 formats?

Also, for the SWC format, what should the Structure Identifier be if I am not working with neuro data?

Besides, I also notice that all the examples in the ultraVessMorpho2Mesh page are using the command ultraAstroMorpho2Mesh instead. Is this a typo or what is intended?

Thanks a lot in adavance!

Best regards,

Wesley

Lenguaje dominante
C++
Estrellas
37
Forks
6
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Preparar el entorno

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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