Bioconductor/GenomicRanges

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Representation and manipulation of genomic intervals

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Forks: 21
Issues abiertos para principiantes: 0
Issues indexados: 31

Lenguaje dominante: R
Licencia: Sin datos de licencia
Último push a GitHub: 2/9/2026
Última indexación: 20/9/2026
Guía de contribución: Sin guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas
Métricas de merge de PR: Sin PR fusionados en 30 d

Para principiantes Todo

Abierto Todos

Memory Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

Bioconductor/GenomicRanges#96 · Abierto el 18/1/2026
Strange setdiff behavior - identified bug Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

Bioconductor/GenomicRanges#95 · 2 comentarios · Abierto el 29/12/2025
strand is ignored and stranded (seqnames, start, end, strand) tuples are treated as invalid Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 42/100

Bioconductor/GenomicRanges#94 · 2 comentarios · Abierto el 11/12/2025
setdiff GRangesList,GRangesList Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#91 · Abierto el 13/7/2025
resize out of bounds warning message Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#90 · Abierto el 9/7/2025
resize documentation Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

Bioconductor/GenomicRanges#89 · Abierto el 8/7/2025
Bug in unique Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#88 · Abierto el 24/6/2025
Ignoring negative positions when intersecting two `GRanges` objects Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 28/100

Bioconductor/GenomicRanges#87 · Abierto el 17/1/2025
subtract documentation Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 30/100

Bioconductor/GenomicRanges#83 · 7 comentarios · Abierto el 28/12/2023
RleList subsetting has integer overflow on mammal genomes Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 38/100

Bioconductor/GenomicRanges#79 · Abierto el 12/7/2023
Could `GenomicRanges::binnedAverage()` be reused for other purposes? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#77 · 4 comentarios · Abierto el 23/3/2023
Error in getListElement(x, i, ...) : GRanges objects don't support [[, as.list(), lapply(), or unlist() at the moment Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

Bioconductor/GenomicRanges#76 · 17 comentarios · Abierto el 28/2/2023
nearestKNeighbors does not handle seqlevel pruning Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 45/100

Bioconductor/GenomicRanges#74 · 2 comentarios · Abierto el 9/1/2023
setdiff not behaving as expected Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#67 · Abierto el 15/7/2022
Representing missing ranges Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 20/100

Bioconductor/GenomicRanges#66 · Abierto el 20/5/2022
Could we directly save the metadata when we use the function makeTxDbFromGFF? Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/GenomicRanges#57 · Abierto el 13/4/2021
Document and export get_out_of_bound_index Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 48/100

Bioconductor/GenomicRanges#53 · 2 comentarios · Abierto el 19/1/2021
overlaps with character arguments as seqlevels? Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 62/100

Bioconductor/GenomicRanges#52 · 2 comentarios · Abierto el 19/1/2021
GRanges gives 'Error in getListElement' when creating objects Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/GenomicRanges#51 · Abierto el 5/1/2021
GPos doesn't survive round-trip conversion to data.frame Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

Bioconductor/GenomicRanges#46 · 2 comentarios · Abierto el 24/8/2020
pc Performance Slow for Two GRangesList Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#44 · 4 comentarios · Abierto el 31/7/2020
Enhancement: Promoters Calculated Don't Overlap with Other Genes Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#43 · 3 comentarios · Abierto el 29/7/2020
strange code for GenomicRanges:::compatibleStrand Abierto

Bioconductor/GenomicRanges#33 · 1 comentario · 1 asignado · Abierto el 9/2/2020
inner and outer mcols for GRangesFactor Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

Bioconductor/GenomicRanges#30 · 1 comentario · Abierto el 23/6/2019
GRangesFactor should inherit from GenomicRanges Abierto

Bioconductor/GenomicRanges#26 · 1 reacción · 1 asignado · Abierto el 16/6/2019
Making it easier to convert from IGV coordinates Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 40/100

Bioconductor/GenomicRanges#22 · 2 reacciones · Abierto el 4/4/2019
coercion from character vector to GRanges does not report the faulty string Abierto

Bioconductor/GenomicRanges#20 · 1 reacción · 1 asignado · Abierto el 17/1/2019
gaps and GRangesList Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#17 · 3 comentarios · 1 reacción · Abierto el 4/10/2018
findOverlaps with type="equal" and a GRangesList Abierto

Bioconductor/GenomicRanges#16 · 6 comentarios · 1 asignado · Abierto el 4/10/2018
Feature request: make intra- and inter- range transformations work on GPos objects Abierto

Bioconductor/GenomicRanges#12 · 1 reacción · 1 asignado · Abierto el 2/10/2018
Easy access to inner metadata of a GRangesList Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100

Bioconductor/GenomicRanges#6 · 7 comentarios · Abierto el 9/3/2018

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