A big-endian data variable registers, then every query fails: Byte-swapped arrays not supported

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Bewertung

Schwierigkeit
2/5
Geschätzter Aufwand
1-3 Stunden
Anfängerfreundlichkeit
72/100
Issue-Typ
Bug
Klarheit
Klar beschrieben
Aktivitätsstatus
Aktiv
Tech-Stack
numpy, python
Bereich
backend, databases

Rechercherichtung

Beginne bei dem Code, der die Werte eines Datenblocks in eine Arrow-Spalte umwandelt. Da das Issue weder die Datei noch den Test nennt, suche diese Umwandlung und lies die aufrufenden Stellen. Reproduziere das Problem mit dem bereitgestellten Dataset in Big-Endian-Byte-Reihenfolge und der Abfrage. Prüfe anschließend die benachbarten Tests zur Arrow-Konvertierung. Die Aufgabe ist erledigt, wenn die Abfrage für bytevertauschte Werte erfolgreich ist und weiterhin mit Werten in der Byte-Reihenfolge der Maschine funktioniert.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

bug

A Dataset whose data variable is big-endian, as a NetCDF file written on a big-endian machine, or some FITS or binary files, can be, registers without error, and then every query on it fails.

import numpy as np, xarray as xr, xarray_sql as xql

ds = xr.Dataset({"w": (("a",), np.zeros(3, ">f8"))}, coords={"a": np.arange(3)})
ctx = xql.Context()
ctx.from_dataset("t", ds)
ctx.sql("SELECT * FROM t").to_pandas()

On main:

DataFusion error: FFI error: Execution error: Error reading batch from stream: ArrowNotImplementedError: Byte-swapped arrays not supported

pyarrow can't make an array from a byte-swapped NumPy array. With #275, such a Dataset is read lazily, as on main, so it fails the same way.

Expected: the query works. One fix is to convert the values to the machine's byte order (values.astype(values.dtype.newbyteorder("="))) when making a block's Arrow column. That costs a copy, which an array in the machine's byte order doesn't need.

Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
142
Forks
19
Ø Merge
3 T. 47 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
8

Entwicklungsumgebung

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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