Is this the expected behavior of patsy when building a design matrix of a two-level categorical variable without an intercept?
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Bewertung
- Schwierigkeit
- 4/5
- Geschätzter Aufwand
- 3-5 Tage
- Anfängerfreundlichkeit
- 35/100
Rechercherichtung
Führen Sie zunächst den bereitgestellten Python- und patsy.dmatrix-Reproducer mit patsy 0.4.1 aus, vergleichen Sie anschließend die beiden angezeigten Designmatrizen und untersuchen Sie das dabei ausgeübte Verhalten der kategorialen Kodierung. Als erledigt gilt, festzustellen, ob das Ergebnis mit zwei Spalten ohne Interzept beabsichtigt ist, und dieses Verhalten mit einer eindeutigen Regressionsprüfung zu dokumentieren oder zu korrigieren.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
cloned from stackoverflow: http://stackoverflow.com/questions/35944841/is-this-the-expected-behavior-of-patsy-when-building-a-design-matrix-of-a-two-le
(patsy v0.4.1, python 3.5.0)
I would like to use patsy (ideally through statsmodels) to build a design matrix for regression.
The patsy-style formula that I would like to fit is
response ~ 0 + category
where category is a two-level categorical variable. The 0 + ... is supposed to indicate that I do not want the implicit intercept term.
The design matrix that I expect has a single column with zeros and ones indicating whether category has the base-level (0) or the other level (1).
The following code:
import pandas as pd
import patsy
df = pd.DataFrame({'category': ['A', 'B'] * 3})
patsy.dmatrix('0 + category', data=df)
Outputs:
DesignMatrix with shape (6, 2)
category[A] category[B]
1 0
0 1
1 0
0 1
1 0
0 1
Terms:
'category' (columns 0:2)
which is singular and not what I want.
When I instead run
import pandas as pd
import patsy
df = pd.DataFrame({'category': ['A', 'B'] * 3})
patsy.dmatrix('category', data=df)
the output is
DesignMatrix with shape (6, 2)
Intercept category[T.B]
1 0
1 1
1 0
1 1
1 0
1 1
Terms:
'Intercept' (column 0)
'category' (column 1)
which is correct for the model which includes an intercept, but still not what I want.
Is the output without an intercept the intended behavior? If so, why?
Am I just confused about how this design matrix is supposed to work with standard coding?
I know that I can edit the design matrix to make my regression work the way I intend, but if this is a bug I'd like to see it fixed in patsy.
- Vorherrschende Sprache
- Python
- Sterne
- 990
- Forks
- 106
- Ø Merge
- 7 T. 34 Min.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 1
Entwicklungsumgebung
Die Einrichtungsdateien dieses Projekts haben wir noch nicht geprüft. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.
Erste Schritte
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