nf-core/sarek

Tutorial: CNV calling

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#1.713 geöffnet am 30.10.2024

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Beschreibung

Topic

CNVs analysis using Sarek

Tasks to realise the tutorial

  1. identify appropriate software
  2. simulate CNV data (max size 100Mb each)
  3. prepare gitpod / codespaces environment and build code
  4. prepare theoretical intro
  5. write down hands-on tutorial

Contributor Guide

Research-Richtung
Befolgen Sie die Aufgabenliste: Identifizieren Sie geeignete Software zur CNV Erkennung, simulieren Sie CNV Daten (max. 100 MB pro Stück), bereiten Sie die Gitpod/Codespaces Umgebung vor und bauen Sie den Code, bereiten Sie eine theoretische Einführung vor und schreiben Sie ein praktisches Tutorial.
Tech Stack
Keine
Domain
data
Issue Type
Dokumentation
SchwierigkeitGeschätzte Implementierungsschwierigkeit für neue Contributors, von 1 für sehr kleine Änderungen bis 5 für Expertenarbeit.
1
Geschätzte ZeitEin grober Zeitrahmen, um zu recherchieren, zu implementieren, zu testen und einen Pull Request vorzubereiten.
Halber Tag
AktivitätsstatusWie verfügbar das Issue gerade wirkt: frisch, aktiv, stale, blockiert oder wartet auf Maintainer-Input.
Frisch
KlarheitWie klar das Issue die erwartete Änderung, Akzeptanzkriterien und den nächsten Schritt erklärt.
Klar
Voraussetzungen
Git
EinsteigerfreundlichkeitEin Score von 1 bis 100, der schätzt, wie zugänglich dieses Issue für First-Time Contributors ist.
90