cortex-lab/phy

Auf GitHub ansehen

phy: interactive visualization and manual spike sorting of large-scale ephys data

Sterne: 430
Forks: 187
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 77
Ø Merge: 2 Std. 31 Min.
Gemergte PRs (30 T.): 2

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: BSD-3-Clause
Letzter GitHub-Push: 21.8.2026
Zuletzt indexiert: 20.9.2026
Beitragsleitfaden: Kein Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: Keine Anfänger-Labels indexiert

Einsteigerfreundlich Alles

Offen Alle

Phy is running very slow Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1417 · 3 Kommentare · Erstellt am 09.9.2026
Blurred PCAs in the FeatureView Offen

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

cortex-lab/phy#1410 · 1 Kommentar · Erstellt am 13.8.2026
Error with: QWidget: Must construct a QApplication before a QWidget Offen

area: installation status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1362 · 2 Kommentare · Erstellt am 20.12.2025
Unsuccessful in installing plugins Offen

area: plugins status: needs-info type: question

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1351 · 1 Kommentar · Erstellt am 16.9.2025
CITATION file request Offen

area: documentation priority: low type: enhancement

Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1343 · Erstellt am 22.5.2025
Templates and mean waveforms have a different offset Offen

area: visualization status: confirmed type: bug

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1332 · Erstellt am 27.2.2025
GLError (invalid operation) in phy when running via RDP on Windows Server 2019 Offen

area: installation priority: low status: confirmed type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1328 · Erstellt am 08.2.2025
Added a peristimulus histogram viewer - make pull request? Offen

area: plugins type: enhancement

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1325 · Erstellt am 10.1.2025
Segmentation Fault after Set state for FeatureView. Offen

area: installation status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1311 · 2 Kommentare · Erstellt am 18.10.2024
ProbeView shows multiple shanks in the case of staggard channel locations. Offen

area: visualization priority: low type: enhancement

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 28/100

cortex-lab/phy#1303 · Erstellt am 19.8.2024
after splitting in phy the amp is not recomputed Offen

area: data type: bug

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 32/100

cortex-lab/phy#1293 · 1 Kommentar · Erstellt am 04.7.2024
OpenGL error loading datasets that previously opened without issue Offen

area: installation priority: low type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1291 · 4 Kommentare · Erstellt am 01.7.2024
Regarding the issue of drawing 2D probes. Offen

area: visualization type: enhancement

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1276 · 4 Kommentare · Erstellt am 20.5.2024
Shank visualization Offen

area: visualization priority: low type: enhancement

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1262 · 2 Kommentare · Erstellt am 25.3.2024
Label mismatch in WaveformView and FeatureView vs. Correlogram View and n_spikes Offen

area: data priority: high status: confirmed type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

cortex-lab/phy#1261 · 9 Kommentare · Erstellt am 20.3.2024
Issue loading and visualizing previously curated data Offen

area: data status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

cortex-lab/phy#1258 · 2 Kommentare · Erstellt am 08.3.2024
Crash in phy with Exception in paintGL Offen

area: installation status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

cortex-lab/phy#1243 · 2 Kommentare · Erstellt am 04.1.2024
Missing Amplitudeview Offen

area: visualization status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

cortex-lab/phy#1242 · 4 Kommentare · Erstellt am 21.12.2023
Programmatically save cluster_info.tsv Offen

area: data type: enhancement

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1241 · 5 Kommentare · 1 Reaktion · Erstellt am 19.12.2023
Waveforms view only show mean waveforms Offen

area: visualization status: confirmed type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1238 · 10 Kommentare · Erstellt am 24.11.2023
Problem with get_cluster_spike_waveforms Offen

area: data type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1208 · Erstellt am 26.5.2023
Adjust default zoom for waveforms vs templates in WaveformView? Offen

area: visualization type: enhancement

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

cortex-lab/phy#1201 · Erstellt am 02.3.2023
Problem with OpenGL Drivers [Ubuntu 22.04] Offen

area: installation type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100

cortex-lab/phy#1196 · 2 Kommentare · Erstellt am 17.2.2023
Inconsistent Behavior with using phy with multiple users on same server Offen

area: gui status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

cortex-lab/phy#1194 · 1 Kommentar · Erstellt am 08.2.2023
Missing files in cache folders when using phy on different computer Offen

area: data status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 52/100

cortex-lab/phy#1191 · 1 Kommentar · Erstellt am 25.1.2023
Best channel does not have the largest amplitude for its waveform template? Offen

area: data type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1187 · Erstellt am 13.12.2022
chn 0 giving me no feature and amplitude value Offen

area: data status: confirmed type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1184 · 3 Kommentare · Erstellt am 27.11.2022
Clusters in Waveform View Unaligned Offen

area: visualization status: confirmed type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1155 · 2 Kommentare · 2 Reaktionen · Erstellt am 21.4.2022
In WaveformView, channel locations incorrect Offen

area: data status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

cortex-lab/phy#1147 · 2 Kommentare · Erstellt am 06.4.2022
No state set to SimilarityView and WaveformView when starting gui Offen

area: visualization status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

cortex-lab/phy#1144 · 1 Kommentar · Erstellt am 18.3.2022
Peak activity and template appear on different channels Offen

area: data type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1137 · Erstellt am 10.2.2022
Strange Splitting Offen

area: data priority: high status: confirmed type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1133 · 2 Kommentare · Erstellt am 30.1.2022
problems with trace view Offen

area: visualization status: needs-info type: question

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1130 · 1 Kommentar · Erstellt am 26.12.2021
Quickly filter by time in WavevormView, TemplateFeatureView, FeatureView, CorrelogramView Offen

area: visualization type: enhancement

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1127 · Erstellt am 22.11.2021
AmplidueView scattered at 0 amplidude Offen

area: data type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1125 · Erstellt am 17.11.2021
GLError - clusterview OK but waveforms or other views are not displayed Offen

area: installation status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1117 · 14 Kommentare · 1 Reaktion · Erstellt am 30.9.2021
XmbText result code -2 Offen

area: performance status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

cortex-lab/phy#1108 · 1 Kommentar · Erstellt am 25.8.2021
Traceview shows invalid traces for spikes Offen

area: data type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1103 · Erstellt am 29.7.2021
Split cluster based on raw amplitude view Offen

area: visualization type: enhancement

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 20/100

cortex-lab/phy#1099 · 2 Kommentare · Erstellt am 24.6.2021
Co-Curing multiple sessions worth of data Offen

area: data type: enhancement

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

cortex-lab/phy#1096 · 2 Kommentare · Erstellt am 13.5.2021
count the number of filtered clusters Offen

area: gui type: enhancement

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

cortex-lab/phy#1093 · Erstellt am 18.4.2021
TraceView feature request: center the cluster channels & auto-update Offen

area: visualization type: enhancement

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

cortex-lab/phy#1092 · Erstellt am 17.4.2021
Feature Request: Density toggle on waveform view Offen

area: visualization type: enhancement

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1090 · Erstellt am 08.4.2021
Problem with WaveformView Offen

area: visualization status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

cortex-lab/phy#1082 · 4 Kommentare · Erstellt am 26.2.2021
Incorrect channel selection in featureView (ctrl+click in waveformview) Offen

area: data scope: legacy-kwik status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1080 · 2 Kommentare · Erstellt am 22.2.2021
segmentation fault, seemingly random on multiple datasetes Offen

area: installation status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1078 · 4 Kommentare · Erstellt am 22.2.2021
Sort traceview by channel ID? Offen

area: visualization type: enhancement

Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

cortex-lab/phy#1076 · Erstellt am 17.2.2021
Error when executing action next Offen

area: performance status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

cortex-lab/phy#1074 · 5 Kommentare · Erstellt am 14.2.2021
redefining PC space for feature view Offen

area: data type: enhancement

Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1065 · Erstellt am 13.1.2021
GUI resets to default view Offen

area: gui status: needs-info type: bug

Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

cortex-lab/phy#1061 · 1 Kommentar · Erstellt am 14.12.2020

cortex-lab/phy

Neue Issues direkt in Ihr Postfach