`base::cbind()`

Offen

#116 erstellt am 31.5.2024 3 Kommentare 0 Reaktionen 0 zugewiesene Personen Auf GitHub ansehen

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Bewertung

Schwierigkeit: 4/5
Geschätzter Aufwand: 3-5 Tage
Anfängerfreundlichkeit: 35/100

Issue-Typ: Feature
Klarheit: Größtenteils klar
Aktivitätsstatus: Veraltet
Tech-Stack: r
Bereich: data

Rechercherichtung

Beginne damit, den gemeldeten Fehler bei base::cbind(x, x) mit einer HDF5Matrix ohne angehängte Bioconductor-Pakete zu reproduzieren, und vergleiche ihn anschließend mit BiocGenerics::cbind(x, x). Das Issue nennt keine Dateien oder Tests; als abgeschlossen gilt die Aufgabe, wenn das unterstützte Binding-Verhalten klar ist und der Fall base::cbind behandelt oder ausdrücklich dokumentiert wird.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

When x is an HDF5Matrix, but I haven't attached any BioC packages, I get:

> cbind(x, x)
Error: unable to find an inherited method for function ‘bindCOLS’ for signature ‘x = "HDF5Matrix"’

Seemingly, this is because DelayedArray only implements BiocGenerics::cbind and not base::cbind (no idea how that's even possible though), so calling it directly does work: BiocGenerics::cbind(x, x). library(DelayedArray), which is the more typical way to use this, also works because it overrides base::cbind with BiocGenerics::cbind.

Is there any reason why base::cbind() isn't implemented?

Vorherrschende Sprache: R
Sterne: 29
Forks: 12
PR-Merge-Kennzahlen: Keine gemergten PRs in 30 T.

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Erste Schritte

Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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