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AllenInstitute
48 indexierte Repositories · Auf GitHub ansehen
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AllenSDK
code for reading and processing Allen Institute for Brain Science data
Jupyter Notebook · 398 Sterne
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bmtk
Brain Modeling Toolkit
Python · 336 Sterne
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abc_atlas_access
Documentation and examples demonstrating how to access data from the Allen Brain Cell Atlas
Jupyter Notebook · 124 Sterne
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openscope_databook
OpenScope databook: a collaborative, versioned, data-centric collection of foundational analyses for reproducible systems neuroscience 🐁🧠...
Python · 76 Sterne
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cell_type_mapper
Repository for storing prototype functionality implementations for the BKP
Python · 58 Sterne
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scrattch
Single cell RNA-seq analysis for transcriptomic type characterization
HTML · 43 Sterne
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MIES
Multichannel Igor Electrophysiology Suite
IGOR Pro · 30 Sterne
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zarr_vectors
a place to work on a specification for skeletons
22 Sterne
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biofile-finder
An open-use web application created for easy access, collaboration, and sharing of datasets through rich metadata search, filter, sort, a...
TypeScript · 22 Sterne
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Python · 17 Sterne
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microns_tutorial
MICrONS databook and analysis tutorials
HTML · 12 Sterne
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ZeroMQ-XOP
The ZeroMQ XOP enables Igor Pro to interface over the network using a ZeroMQ messaging layer and JSON as message format
C · 10 Sterne
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vis
Typescript packages for building big-data visualization tools & components, with examples for a variety of common data types & formats
TypeScript · 10 Sterne
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AllenInstituteTaxonomy
https://alleninstitutetaxonomy.readthedocs.io/en/latest/schema.html#schema
R · 10 Sterne
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neuroanalysis
Modular analysis tools for neurophysiology data
Python · 9 Sterne
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serra
A multi-material meshing library written in Rust
Python · 9 Sterne
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Jupyter Notebook · 8 Sterne
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spatial_compare
package for comparing spatial transcriptomics datasets
Jupyter Notebook · 7 Sterne
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Jupyter Notebook · 6 Sterne
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BigFeta
Big FeaTure Aligner: a scalable solution for feature alignment
Python · 6 Sterne
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Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen
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UX
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
AllenInstitute/biofile-finder#970 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Auto-generate API docsOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AllenInstitute/vis#313 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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ClinicalVisitOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
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bug upload
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100
AllenInstitute/npc_sessions#172 ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 10/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100
AllenInstitute/AllenSDK#2785 ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 74/100
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
AllenInstitute/biodata-schema#78 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100
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Cyclic IFOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 45/100
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CohortOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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AnalysisBrowser Optimization SweepFormula
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
AllenInstitute/MIES#2783 ·
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What is v2?Offen
Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 25/100
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What is v1?Offen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 15/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100
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Clean up stale branchesOffen
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100
AllenInstitute/biofile-finder#958 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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UX
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AllenInstitute/biofile-finder#957 · 1 Kommentar ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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make 1.0 releaseOffen
Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 72/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 48/100
AllenInstitute/biodata-schema#66 · 2 Kommentare · 1 Reaktion ·
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bug
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100
AllenInstitute/biofile-finder#948 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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bug
Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 92/100
AllenInstitute/AllenSDK#2783 ·
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 88/100
AllenInstitute/biorealistic-v1-model#15 · 1 Kommentar ·
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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SweepFormula
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
AllenInstitute/MIES#2777 ·
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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SweepFormula
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
AllenInstitute/MIES#2775 ·
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SweepFormula
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100
AllenInstitute/MIES#2774 ·
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Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100
AllenInstitute/biofile-finder#941 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 88/100
AllenInstitute/biofile-finder#934 · 1 Reaktion ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
AllenInstitute/biofile-finder#931 ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
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ABC Atlas linksOffen
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 35/100
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Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
AllenInstitute/serra#1 · 5 Kommentare ·
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enhancement question schema
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
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