Tracing only a subset of state variables in mcmc.sample_chain
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评估
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- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 35/100
- Issue 类型
- 功能
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 停滞
调研方向
从 issue 中描述的入口点 mcmc.sample_chain 及其 trace_fn 行为开始。确定如何选择采样状态，并定义一种在不存储 z 的情况下保留 alpha 的方式；当 sample_chain 能够仅返回请求的状态变量，同时保留现有的 tracing 行为时，即视为完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
I would like to sample from a posterior distribution which depends on two variables: z and alpha. alpha is a scalar and z is a large vector of hidden variables. I am only interested in the marginal posterior distribution of alpha. When I construct a sample with mcmc.sample_chain it always gives me the full state of the chain for each element of the sample. For large sample sizes and large vectors z this can lead to memory problems. Is there a way to tell sample_chain to only return samples for alpha, but not for z? I have experimented with the trace_fn option, but with that it seems I'm only able to output additional variables like acceptance flags.
- 主要语言
- Jupyter Notebook
- 星标
- 4.4k
- 派生
- 1.1k
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
- 没有 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 没有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
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- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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