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olgabot/10xdashC++

Pairwise similarity metrics for 10x barcoded RNASeq datasets

最近提交 2023年12月11日

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olgabot/2020-test-senchaJupyter Notebook

最近提交 2020年5月31日

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olgabot/2020-workflows-paperHTML

Strategies for leveraging workflow systems to streamline large-scale biological analyses

最近提交 2020年6月2日

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olgabot/2021-01-27-olga-remove-proteinStandard ML

最近提交 2021年1月28日

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olgabot/2021-paper-metapangenomesHTML

最近提交 2022年6月5日

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olgabot/2022-ced9-bcl2Standard ML

Structural homology between C. elegans Ced9 and human BCL2

最近提交 2024年11月6日

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olgabot/2022-mouse-lemur-tabula-microcebus

Code for cross-species and uTAR sequence homology analyses for two Tabula Microcebus papers

最近提交 2022年9月9日

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olgabot/2022-sourmash-multigather-kmer-stats

Do sourmash multigather, but use a background k-mer distribution model to quantify significance of matches, and report all matching k-mer sequences

最近提交 2022年12月1日

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olgabot/2022-sourmash-multisearchJupyter Notebook

Search multiple query k-mer signatures against a database

最近提交 2023年2月18日

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olgabot/2023-functional-homology-paperHTML

最近提交 2024年3月15日

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olgabot/Deedy-ResumeTeX

A one page , two asymmetric column resume template in XeTeX that caters to an undergraduate Computer Science student

最近提交 2015年12月2日

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olgabot/FRC_alignC++

Computes FRC from SAM/BAM file and not from afg files

最近提交 2018年8月7日

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olgabot/GPfatesPython

最近提交 2017年2月20日

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olgabot/GSEApyPython

Gene Set Enrichment Analysis in Python

最近提交 2017年7月9日

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olgabot/Keras-genomicsPython

Perform hyper-parameter tuning, training, testing and prediction with Keras

最近提交 2018年3月29日

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olgabot/MISOC

MISO: Mixture of Isoforms model for RNA-Seq isoform quantitation

最近提交 2013年7月13日

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olgabot/MultiQCPython

Aggregate results from bioinformatics analyses across many samples into a single report.

最近提交 2018年7月13日

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olgabot/NouGATPython

最近提交 2017年4月5日

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olgabot/OrthoFinderPython

Phylogenetic orthology inference for comparative genomics

最近提交 2021年10月8日

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olgabot/OrthologyOntology

Working draft of a common ontology for describing orthology resources

最近提交 2019年10月21日

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