galaxyproject/planemo

可能已有人在做的 issue 排在最后。 全部按时间排序

• Lint: metadata_source is unvalidated, and format_source accepts any param name

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  enhancement

  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 76/100

  galaxyproject/planemo#1722 · 2026年9月21日 创建

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• Build and Target a Modern Galaxy Docker Image

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  bug enhancement

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100

  galaxyproject/planemo#1721 · 2026年9月21日 创建

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• Retire or Modernize the Planemo Virtual Appliance Maybe?

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  docs missing enhancement help wanted

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100

  galaxyproject/planemo#1720 · 1 条评论 · 2026年9月21日 创建

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• Docs toctree has no task-level grouping; automating_workflows is a 31-line stub

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  docs missing workflows

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  galaxyproject/planemo#1719 · 2026年9月19日 创建

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• Workflow tutorial is anchored to the archived usegalaxy-eu/workflow-testing repo

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  docs missing workflows

  难度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100

  galaxyproject/planemo#1718 · 2026年9月19日 创建

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• Workflow test collection assertions are silently skipped unless spelled `element_tests`

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  难度 3/5 1-2 天 新手友好度 76/100

  galaxyproject/planemo#1705 · 2026年9月14日 创建

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• workflow_lint --iwc does not check the date on the newest CHANGELOG heading

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  galaxyproject/planemo#1694 · 2026年9月9日 创建

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• workflow_lint --iwc should error, not warn, when a workflow has no test cases

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  galaxyproject/planemo#1693 · 2026年9月9日 创建

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• Run Engine for Embedded Galaxy

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  enhancement

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100

  galaxyproject/planemo#1686 · 2026年8月25日 创建

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• Deduplicate planemo.io.wait_on in favor of galaxy.util.wait.wait_on

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  galaxyproject/planemo#1680 · 2026年8月20日 创建

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• Meta: repository-level linting for data managers and tool data tables

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  enhancement linting

  难度 5/5 一周以上 新手友好度 28/100

  galaxyproject/planemo#1672 · 2 条评论 · 2026年7月24日 创建

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• planemo run --no_wait crashes with UnboundLocalError for tools

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  galaxyproject/planemo#1668 · 2026年7月21日 创建

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• Global config values bypass click.Path conversion (resolve_path is dead code)

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  galaxyproject/planemo#1667 · 2026年7月21日 创建

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• Add a GA4GH WES execution engine to `planemo run` (`--engine wes`)

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  galaxyproject/planemo#1651 · 2026年6月6日 创建

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• workflow_test_init fails with FileNotFoundError when workflow input labels contain forward slashes (/)

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  galaxyproject/planemo#1629 · 2026年3月25日 创建

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• planemo test crashes when workflow test specifies non-existent outputs

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  galaxyproject/planemo#1625 · 2026年3月5日 创建

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• Improve version linter

  可能重新可做 @bernt-matthias 于 233 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  galaxyproject/planemo#1613 · 已指派 1 人 · 2026年2月9日 创建

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• Planemo improvements

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  galaxyproject/planemo#1602 · 2026年1月27日 创建

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• Test functionality for ITs

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  galaxyproject/planemo#1600 · 3 个 reaction · 2026年1月14日 创建

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• `planemo lint` false positive warning about `HelpInvalidRST` when using local images?

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  galaxyproject/planemo#1589 · 1 条评论 · 2025年12月17日 创建

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• SyntaxWarning:

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  galaxyproject/planemo#1584 · 2025年11月13日 创建

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• `--test_data` option of `planemo t` does not work

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  galaxyproject/planemo#1536 · 2025年6月13日 创建

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• mulled-search gives error when searching GitHub sources due to lack of valid token

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  galaxyproject/planemo#1535 · 2025年6月4日 创建

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• Getting ShedVersion error on unmodified tools that reside in the same directory that modified tools

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  galaxyproject/planemo#1525 · 1 条评论 · 2025年5月12日 创建

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• workflow_test_init incorrect run from invocation

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  galaxyproject/planemo#1522 · 4 条评论 · 2025年4月28日 创建

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• configure log level - decrease current output

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  galaxyproject/planemo#1516 · 1 条评论 · 2025年4月15日 创建

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• Back up tool_test_output.* rather than overwriting

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  galaxyproject/planemo#1515 · 2025年4月9日 创建

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• Default python version to loosely defined

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  galaxyproject/planemo#1489 · 2 条评论 · 2025年1月27日 创建

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• CWL steps that return arrays of files should be discovered datasets

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  galaxyproject/planemo#1484 · 1 条评论 · 2024年12月12日 创建

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• Enhancements for IWC

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  galaxyproject/planemo#1482 · 1 条评论 · 2024年11月22日 创建

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• planemo's configuration of bioblend's api key prevents running commands without authentication that don't require it

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  galaxyproject/planemo#1476 · 4 条评论 · 2024年9月26日 创建

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• Synchronize with Galaxy Post 24.2 Publication

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  galaxyproject/planemo#1475 · 1 条评论 · 2024年9月24日 创建

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• Return inputs ID in --test_output_json outputs

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  galaxyproject/planemo#1449 · 2024年4月29日 创建

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• Allow initializing workflows from failed invocations

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  galaxyproject/planemo#1435 · 2024年3月7日 创建

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• Output files detected with size 0 on planemo tests

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  galaxyproject/planemo#1431 · 2 条评论 · 2024年2月10日 创建

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• Input staging problem: History not found

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  galaxyproject/planemo#1423 · 2024年1月17日 创建

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• planemo lint workflow tests improvement

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  galaxyproject/planemo#1413 · 2023年12月1日 创建

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• planemo lint multiple

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  galaxyproject/planemo#1411 · 2023年11月20日 创建

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• Uploading/mirroring of test data

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  galaxyproject/planemo#1409 · 1 条评论 · 2023年11月17日 创建

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• planemo autoupdate workflows improvements

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  galaxyproject/planemo#1404 · 2023年11月13日 创建

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• planemo should catch when Python isn't there

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  galaxyproject/planemo#1392 · 1 条评论 · 2023年10月6日 创建

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• planemo serve breaks with new docker version when running tools

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  galaxyproject/planemo#1390 · 5 条评论 · 2023年10月3日 创建

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• Expose some history related option to test

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  galaxyproject/planemo#1380 · 2023年7月27日 创建

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• planemo test is not recursive anymore

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  galaxyproject/planemo#1367 · 3 条评论 · 2023年5月9日 创建

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• Symbolic links for tests data are not taken into account

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  galaxyproject/planemo#1366 · 1 条评论 · 2023年5月9日 创建

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• [feature request] workflow_lint could use a structured data output

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  enhancement

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  galaxyproject/planemo#1360 · 1 条评论 · 2023年3月24日 创建

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• Planemo test denies having updated test data

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  galaxyproject/planemo#1359 · 2023年3月14日 创建

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• Add docker install requirement in the docs

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  galaxyproject/planemo#1354 · 3 条评论 · 2023年2月16日 创建

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• `planemo test` parameter `--job_output_files` seems unused

  可能重新可做 @mvdbeek 于 761 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭

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  galaxyproject/planemo#1352 · 1 条评论 · 已指派 1 人 · 2023年2月13日 创建

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• planemo serve does not display images in help section

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  galaxyproject/planemo#1349 · 1 个 reaction · 2023年1月26日 创建

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