steps to speed up job submission?
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 20/100
- Issue 类型
- 文档
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- r
调研方向
先从 future.batchtools 文档开始，了解作业提交、SLURM 分配、worker 启动和依赖关系处理。使用一小批作业重现所报告的延迟，然后追踪是哪个阶段占用了这段时间。完成的标准是解释清楚提交顺序和相关配置选项，或确定一个具体的性能问题。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
I'm using future.batchtools via drake, and just got my first plan running on the cluster. It seems to take about one minute for each job submitted, and since I'm trying to submit several hundred jobs, that's not ideal (although it's not a deal-breaker, because I expect each job to take many hours to finish). I'm not sure what I might be able to change in order to speed this up. I haven't dived into the code, but my idea of what needs to happen to start a worker is:
- analyse the code to find dependencies
- submit the job to the scheduler (SLURM in my case)
- wait for the job to be allocated
- wait for the worker to start up (and load libraries?)
- send data to the worker (and libraries?)
Is this basically accurate?
Does the worker load libraries already installed on its node, or are all libraries sent to the worker by the master? If the latter, then reducing library dependencies seems like a potential avenue to try.
- 主要语言
- R
- 星标
- 87
- 派生
- 10
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
- 没有 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 没有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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