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NHLBI-BDC-DMC-HV
BDC Harmonized Variables

Python · 2 个 star

适合新手全部

未关闭全部

可能已有人在做的 issue 排在最后。全部按时间排序

JHS cohort review: MHXA52E1 'other revascularization or bypass' coded OMOP:4178405, a qualifier value (F042)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external JHS

难度 4/5 1-2 天新手友好度 15/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#938 · 2026年10月16日创建

维护者通常 3 天内回复
MESA cohort review: adjudicated death types written as R99 or ICD-10 ranges (dthtype; F031)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external MESA

难度 4/5 3-5 天新手友好度 18/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#937 · 2026年10月16日创建

维护者通常 3 天内回复
ARIC and WHI cohort review: should lab upper-limit-of-normal values be kept as reference ranges? (F021)
未关闭
- 哪里不对？
ARIC awaiting: external WHI

难度 4/5 1-2 天新手友好度 15/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#936 · 2026年10月16日创建

维护者通常 3 天内回复
FHS cohort review: race_sum / eth_sum code 88 (defaulted race and ethnicity) mapped to White / Not Hispanic (F008)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external FHS

难度 5/5 一周以上新手友好度 5/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#935 · 2026年10月16日创建

维护者通常 3 天内回复
CARDIA Years 0 / 2 hypertension: meaning of HBPG1 'diagnosis based on more than one visit? No' -- question for the CARDIA team
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external CARDIA

难度 4/5 3-5 天新手友好度 18/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#932 · 1 条评论 · 2026年10月15日创建

维护者通常 3 天内回复
CARDIA Year 0 A05LYMPH: confirm the unit (percent of white cells or absolute count) with the CARDIA team
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external CARDIA

难度 3/5 半天新手友好度 25/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#931 · 2026年10月15日创建

维护者通常 3 天内回复
CARDIA servings totals: should one missing item make the weekly total missing? (cohort review, from #904)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external CARDIA

难度 4/5 1-2 天新手友好度 15/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#930 · 2026年10月15日创建

维护者通常 3 天内回复
CARDIA chronic bronchitis / emphysema: onset age on ABSENT rows when 'still have' or 'doctor confirmed' is No -- needs a ruling (HISTORICAL?)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal CARDIA curator defect severity: low

难度 5/5 3-5 天新手友好度 12/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#926 · 2026年10月15日创建

维护者通常 3 天内回复
Drug records with a status but no drug: FHS beta-blocker / calcium-channel-blocker group codes and CARDIA statin / BP-medication blocks
未关闭
- 哪里不对？
CARDIA defect FHS severity: moderate

难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#925 · 1 条评论 · 2026年10月15日创建

维护者通常 3 天内回复
Cause of death left empty: CHS non-cardiovascular deaths have no cause, and ARIC / CARDIA give living participants a cause-of-death record
未关闭
- 哪里不对？
ARIC CARDIA CHS defect MESA severity: moderate

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#924 · 1 条评论 · 2026年10月15日创建

维护者通常 3 天内回复
ARIC v8 -> v9 migration: spec changes held until the move to v9
未关闭
- 哪里不对？
ARIC status: deferred

难度 5/5 一周以上新手友好度 5/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#922 · 2 条评论 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
Follow-ups split from #872: ARIC Visit 6 duplicate drug flags, WHI outcome-form ages, CARDIA Y01 criteria flags, carotid artery disease concept, CHS id type check
未关闭
- 哪里不对？
defect severity: moderate

难度 4/5 3-5 天新手友好度 12/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#921 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
Event, form and ancillary tables emitted as Visits: one per-table decision (split from #872)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal defect severity: moderate

难度 4/5 一周以上新手友好度 12/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#920 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
ECG backlog: unmapped FHS PR/QT intervals, flat QRS blocks, QTc code request to HM (split from #872)
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 5/5 一周以上新手友好度 10/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#919 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
FHS albumin_urine B350: unknown scale for dipstick codes 1, 3 and 10 (897 rows) -- question for the FHS team
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external defect FHS severity: moderate

难度 4/5 一周以上新手友好度 15/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#918 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
CHS ECG intervals: add age_at_observation to the PR / QRS / QT Set members in qrs_ekg.yaml
未关闭
- 哪里不对？
CHS defect severity: low

难度 3/5 半天新手友好度 52/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#917 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
associated_evidence solution (c): Entity identifiers for STUDY_RECORD Conditions (split from #802, deferred)
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 5/5 一周以上新手友好度 8/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#915 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
QC tooling: cross-study value-range check and conversion-aware QC for unit factors (deferred)
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 4/5 3-5 天新手友好度 15/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#914 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
QC tooling and docs cleanup: stale hv_dataqc config and doc references, DrugExposure dedup check, AI-repo gold refresh (deferred)
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 3/5 1-2 天新手友好度 18/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#913 · 2 条评论 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
FHS ven_thromb pht006005 g3a230/g3a231: no mapping for code 1 (0 rows today, low impact)
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 45/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#911 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
FHS/CHS cleanup (low impact): FHS A78 diuretic file placement, FHS edu_lvl dead keys, CHS apnea AHI variable check
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#909 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
Measurement labels (low impact): spirometry predicted values lack prediction equation; sleep heart rate lacks 'during sleep' context
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 3/5 半天新手友好度 20/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#908 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
Vegetable servings unit label: {servings}/wk should be {#}/wk (low impact)
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 2/5 1 小时以内新手友好度 72/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#907 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
Unmapped stray codes and free-text drug names (low impact): ARIC/CARDIA/FHS/CHS/MESA/COPDGene/JHS, 13 items
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#906 · 1 条评论 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
Condition code review (low impact): ARIC pulmonary hypertension in hypertension.yaml, CARDIA carotid plaque code, FHS FA189 syphilis/murmur codes
未关闭
- 哪里不对？
severity: low status: deferred

难度 3/5 半天新手友好度 22/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#905 · 1 条评论 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
CHS D-dimer: confirm the unit (values fit ng/mL, specs say mg/L)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external CHS

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 22/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#902 · 1 条评论 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
FHS cohort review: medication duplicates and alpha agonist / blocker codes (D12, D14, D15)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external FHS

难度 4/5 3-5 天新手友好度 18/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#901 · 1 条评论 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
Decision with WHI: which table produces WHI YEAR n for Clinical Trial participants (D02, D05)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external WHI

难度 5/5 一周以上新手友好度 6/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#898 · 2026年10月13日创建

维护者通常 3 天内回复
hv-dataqc never checks SdohObservation or ResearchStudy output (missing from entity_files)
未关闭
- 哪里不对？
hv-dataqc internal systems

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 78/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#896 · 2026年10月12日创建

维护者通常 3 天内回复
JHS: confirm how dbGaP contact occasions (VISIT 1/6/9) map to Exams 1/2/3
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external JHS

难度 4/5 3-5 天新手友好度 20/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#895 · 2026年10月9日创建

维护者通常 3 天内回复
HV-Lint Gate v2: deletion inventory, id templates, units, normalised duplicates, mutation suite
未关闭
- 哪里不对？
enhancement hv-lint internal systems

难度 5/5 一周以上新手友好度 8/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#893 · 2026年10月9日创建

维护者通常 3 天内回复
Records lost, unlinked or incomplete (HV-Lint review 2026-10)
未关闭
- 哪里不对？
ARIC CARDIA CHS COPDGene defect FHS HCHS-SOL JHS MESA severity: moderate WHI

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#884 · 4 条评论 · 2026年10月8日创建

维护者通常 3 天内回复
ARIC spirometry spec uses PFTB subject id phv00516587 in two PULM21 blocks
未关闭
- 哪里不对？
defect severity: low

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 95/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#880 · 1 条评论 · 2026年10月6日创建

维护者通常 3 天内回复
HV curator questions after the 2026-10 cleanup PRs
未关闭
- 哪里不对？
defect severity: moderate

难度 5/5 一周以上新手友好度 15/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#873 · 7 条评论 · 2026年10月6日创建

维护者通常 3 天内回复
Heart rate during sleep: add sleep context (from #838)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal CHS enhancement severity: low

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 62/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#868 · 2026年10月4日创建

维护者通常 3 天内回复
FHS: particulate e-selectin
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external domain expert FHS

难度 5/5 一周以上新手友好度 28/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#826 · 1 条评论 · 2026年9月16日创建

维护者通常 3 天内回复
HV-DataQC: close the blind spot that let #814 and #815 through (4 enhancements)
未关闭
- 哪里不对？
hv-dataqc internal systems

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#816 · 2026年9月10日创建

维护者通常 3 天内回复
known_issues: unreachable variable_key entries in ARIC.yaml (4 entries) + lint gap
未关闭
- 哪里不对？
internal systems

难度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#813 · 1 条评论 · 2026年9月9日创建

维护者通常 3 天内回复
Curator ruling needed: 24 concept families folded from 35 alias spellings (Set-vs-standalone + synonyms)
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal enhancement severity: low

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#811 · 1 条评论 · 2026年9月6日创建

维护者通常 3 天内回复
CHS: check provenance for conditions *59
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal CHS domain expert

难度 3/5 1-2 天新手友好度 52/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#807 · 1 条评论 · 2026年9月1日创建

维护者通常 3 天内回复
associated_evidence values contradict their source variables (~130 blocks); blocks the Q2 provenance rule
可能重新可做 @diatomsRcool 于 48 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
ARIC awaiting: external bug CARDIA CHS curator FHS severity: high status: needs-triage WHI

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#800 · 4 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年8月31日创建

维护者通常 3 天内回复
Curie CSVs keep stale CURIEs on companion PHV rows after a block-level change
可能重新可做 @stephanieshong 于 50 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal internal systems severity: low

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#793 · 1 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年8月29日创建

维护者通常 3 天内回复
FHS albumin_urine.yaml: four value_mappings keys on phv00007968 match no data, two observed values unmapped
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external domain expert FHS QAQC severity: low

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#788 · 1 条评论 · 2026年8月28日创建

维护者通常 3 天内回复
Final Enum Clean up issues and proposed fixes
未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal

难度 3/5 1-2 天新手友好度 50/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#779 · 2026年8月27日创建

维护者通常 3 天内回复
Enums vs CURIES in the transform specs
可能重新可做 @amc-corey-cox 于 60 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
defect severity: high

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#758 · 3 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年8月19日创建

维护者通常 3 天内回复
MESA - diabetes.yaml
可能重新可做 @diatomsRcool 于 60 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
awaiting: external domain expert MESA

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#757 · 3 条评论 · 已指派 2 人 · 2026年8月19日创建

维护者通常 3 天内回复
ARIC table pht006469 in Visit 5?
可能重新可做 @diatomsRcool 于 51 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
awaiting: internal defect severity: moderate

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#750 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2026年8月13日创建

维护者通常 3 天内回复
hv-dataqc: deferred pre-PR review findings (F1-F4) from PR #687
可能重新可做 @csiege 于 68 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
internal systems

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#747 · 已指派 1 人 · 2026年8月11日创建

维护者通常 3 天内回复
Add ResearchStudy metadata
未关闭
- 哪里不对？
enhancement severity: low

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#744 · 1 条评论 · 2026年8月10日创建

维护者通常 3 天内回复
COPDGene resting_sao2: confirm ×0.01 unit rescale and declare C5 conversion_factor
可能重新可做 @diatomsRcool 于 73 天前认领，目前没有进行中的 PR。未关闭
- 哪里不对？
COPDGene curator internal systems

RTIInternational/NHLBI-BDC-DMC-HV#737 · 已指派 1 人 · 2026年8月6日创建

维护者通常 3 天内回复

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