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KomaMRI.jl
Koma is a GPU-accelerated, Pulseq-compatible framework for simulating Magnetic Resonance Imaging (MRI) acquisitions. The primary focus of...

Julia · 221 个 star
DICOM.jl
Julia package for reading and writing DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) files

Julia · 58 个 star
BloodFlowTrixi.jl
This package implements 1D and 2D blood flow models for arterial circulation using Trixi.jl, enabling efficient numerical simulation and ...

Julia · 44 个 star
PubChemCrawler.jl
Utilities to programmatically query the PubChem database

Julia · 28 个 star
Thunderbolt.jl
A modular shared-memory high-performance framework for multiscale cardiac multiphysics simulations.

Julia · 26 个 star
NeuroAnalyzer.jl
Julia toolbox for analyzing neurophysiological data

Julia · 22 个 star
BioMedQuery.jl
Julia utilities for interacting with biomedical databases and biomedical application programming interfaces (APIs)

Julia · 19 个 star
ICD_GEMs.jl
ICD_GEMs.jl is a Julia package that allows to translate ICD-9 codes in ICD-10 and viceversa via the General Equivalence Mappings (GEMs) o...

Julia · 17 个 star
MedEye3d.jl
Julia library for visualization and annotation medical images, specialized particularly for rapid development segmentation of 3 dimension...

Jupyter Notebook · 17 个 star
JuliaHealthWebsiteOld
Website for the JuliaHealth organization (powered by Franklin.jl).

Julia · 14 个 star
ARules.jl
Julia package for association rule learning

Julia · 13 个 star
FHIRClient.jl
Julia client for connecting to FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) servers and building SMART on FHIR applications

Julia · 11 个 star
OMOPCDMCohortCreator.jl
Create cohorts from databases utilizing the OMOP CDM

Julia · 10 个 star
PubMedMiner.jl
Julia package for studying co-occurrences in PubMed articles

Jupyter Notebook · 9 个 star
MedImages.jl
Upstream package that provides an interface to the ITK I/O functions in Julia and a bunch of medical imaging analysis workflows

TeX · 9 个 star
MedPipe3D.jl

Julia · 8 个 star
DICOMTree.jl
A small Julia tool for visualizing DICOM metadata.

Julia · 7 个 star
HealthBase.jl
Common namespace for functions and interfaces in the JuliaHealth ecosystem

Julia · 7 个 star
CTakesParser.jl
Julia package to parse the output of Apache cTAKES (clinical text analysis and knowledge extraction system)

Julia · 6 个 star
OMOPCommonDataModel.jl
Pure Julia implementation of the OMOP Common Data Model (CDM)

Julia · 6 个 star
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Fix subdomains_from in transfer operator
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bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

JuliaHealth/Thunderbolt.jl#274 · 2026年9月12日创建
First-class Enzyme and Reactant support - KomaMRI.jl, KomaMRICore.jl
未关闭
- 哪里不对？
contributor-selected selected-project

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/JuliaHealth2026BountyProgram#7 · 2 条评论 · 2026年9月11日创建
[ P2 ] Verification, CI and documentation for the Med*3D packages - MedEye3d.jl, MedImages.jl, MedPipe.jl
未关闭
- 哪里不对？
contributor-selected selected-project

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

JuliaHealth/JuliaHealth2026BountyProgram#5 · 3 条评论 · 2026年9月11日创建
[ P1 ] Apple Metal GPU support for the Med*3D packages - MedEye3d.jl, MedImages.jl, MedPipe.jl
未关闭
- 哪里不对？
contributor-selected selected-project

难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

JuliaHealth/JuliaHealth2026BountyProgram#4 · 5 条评论 · 2026年9月11日创建
`adapt`-able imaging operators - MRIOperators.jl, LinearOperatorCollection.jl, RegularizedLeastSquares.jl
未关闭
- 哪里不对？
contributor-selected selected-project

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/JuliaHealth2026BountyProgram#3 · 6 条评论 · 2026年9月4日创建
Updating MRIReco.jl ecosytem documentation - MRIReco.jl
未关闭
- 哪里不对？
contributor-selected selected-project

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

JuliaHealth/JuliaHealth2026BountyProgram#2 · 12 条评论 · 2026年9月4日创建
Building a pulseq sequence from scratch : rotation of gradient and pulseq
未关闭
- 哪里不对？
bug

难度 3/5 1-2 天新手友好度 62/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#940 · 6 条评论 · 2026年8月28日创建

维护者通常 2 天内回复
Simulating Realistic MRI Gradient Systems - KomaMRI.jl, KomaMRIBase.jl, KomaMRICore.jl
未关闭
- 哪里不对？
contributor-selected selected-project

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/JuliaHealth2026BountyProgram#1 · 6 条评论 · 2026年8月27日创建
Simulate realistic gradient waveforms from scanner-measured GIRFs.
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#938 · 2026年8月27日创建

维护者通常 2 天内回复
Simulating eddy-current-induced gradient distortions
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 45/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#937 · 2026年8月27日创建

维护者通常 2 天内回复
Modify highlighted pacakges
未关闭
- 哪里不对？
help wanted

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 85/100

JuliaHealth/JuliaLifeSciences#10 · 2026年8月24日创建
Add testimonials
未关闭
- 哪里不对？
help wanted

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 88/100

JuliaHealth/JuliaLifeSciences#9 · 2026年8月24日创建
SLR pulse
未关闭
- 哪里不对？
bug

难度 4/5 3-5 天新手友好度 48/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#934 · 3 条评论 · 2026年8月21日创建

维护者通常 2 天内回复
Add GPU magnetization remapping at periodic motion boundaries
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 52/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#930 · 2026年8月13日创建

维护者通常 2 天内回复
Clean up multigrid setup path
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

JuliaHealth/Thunderbolt.jl#265 · 2026年8月4日创建
Add Tachometer CI
未关闭
- 哪里不对？
github_actions performance

难度 3/5 1-2 天新手友好度 38/100

JuliaHealth/Thunderbolt.jl#263 · 2026年8月3日创建
CI test job: 6h timeout from full-res brute-force orientation test + 14 fill-value roundtrip failures
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 42/100

JuliaHealth/MedImages.jl#71 · 1 条评论 · 2026年7月18日创建
BrokenReports does not support HTTP v2
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

JuliaHealth/PubChemCrawler.jl#36 · 2026年6月22日创建
Make types inside simulation less strict to enable extensibility
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#796 · 2026年6月1日创建

维护者通常 2 天内回复
Unified Phantom Framework
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#795 · 6 条评论 · 2 个 reaction · 2026年6月1日创建

维护者通常 2 天内回复
[Stretch Goal] Explore Additional RAG Methods and LLM Providers
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#33 · 2026年5月16日创建
[Pre-GSoC] Create Testing Suite Harness for HealthLLM.jl
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#32 · 1 条评论 · 2026年5月16日创建
[Pre-GSoC] Translation of Additional SQL Queries to FunSQL and Dataset Creation
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 38/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#31 · 2026年5月16日创建
[Pre-GSoC] Create Simple Working Demo of RAG Using HealthLLM.jl
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 55/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#30 · 2026年5月16日创建
[Pre-GSoC] Merge HealthSampleData.jl PR for HuggingFaceHub.jl Support
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#29 · 2026年5月16日创建
Documentation, Reproducibility, and Final Demonstration
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#28 · 2026年5月16日创建
Evaluation Harness and Benchmark Tasks for FunSQL Query Generation
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#27 · 2026年5月16日创建
Baseline RAG Pipeline Refinement for FunSQL.jl Workflow Support
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#26 · 2026年5月16日创建
Spin compartments and spin selection
未关闭
- 哪里不对？
enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#777 · 5 条评论 · 2026年5月7日创建

维护者通常 2 天内回复
Add Docs
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#25 · 2026年4月17日创建
[FEATURE] Add your organization to JuliaHealth "Users / Researchers / Developers" section
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

JuliaHealth/juliahealth.github.io#83 · 2026年4月7日创建
Bug: augmentations.jl contains two conflicting implementations merged into one file
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 55/100

JuliaHealth/MedPipe3D.jl#39 · 2026年3月17日创建
Packages version
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

JuliaHealth/MedPipe3D.jl#32 · 2026年3月11日创建
Raw REPL text in .jl file
未关闭
- 哪里不对？
难度 1/5 1 小时以内新手友好度 68/100

JuliaHealth/MedEval3D.jl#23 · 2026年3月11日创建
issue: GPU-Accelerated & Differentiable 3D Morphological Operations
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 35/100

JuliaHealth/MedImages.jl#62 · 2026年3月4日创建
Add support for fine tuning LLMs using HealthLLM.jl
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 15/100

JuliaHealth/HealthLLM.jl#20 · 2026年2月27日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 30/100

JuliaHealth/OMOPCDMCohortCreator.jl#86 · 2026年2月8日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

JuliaHealth/FHIRClient.jl#171 · 2026年2月8日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

JuliaHealth/MedEye3d.jl#33 · 1 条评论 · 2026年2月8日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

JuliaHealth/ICD_GEMs.jl#11 · 2026年2月8日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

JuliaHealth/BioMedQuery.jl#75 · 2026年2月8日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 38/100

JuliaHealth/NeuroAnalyzer.jl#18 · 3 条评论 · 2026年2月8日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

JuliaHealth/Thunderbolt.jl#242 · 2 条评论 · 1 个 reaction · 2026年2月8日创建
Audit follow-up: Documentation & Community Metadata Improvements
未关闭
- 哪里不对？
难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

JuliaHealth/DICOM.jl#99 · 2026年2月8日创建
General Registry repository URL mismatch after migration to JuliaHealth
未关闭
- 哪里不对？
难度 2/5 1-3 小时新手友好度 35/100

JuliaHealth/BlindingIndex.jl#3 · 2 条评论 · 2026年2月4日创建
General Registry repository URL mismatch after migration to JuliaHealth
未关闭
- 哪里不对？
难度 2/5 1-3 小时新手友好度 45/100

JuliaHealth/MedEval3D.jl#21 · 2026年2月4日创建
General Registry repository URL mismatch after migration to JuliaHealth
未关闭
- 哪里不对？
难度 2/5 1-3 小时新手友好度 35/100

JuliaHealth/MedPipe3D.jl#22 · 2026年2月4日创建
General Registry repository URL mismatch after migration to JuliaHealth
未关闭
- 哪里不对？
难度 2/5 1-3 小时新手友好度 45/100

JuliaHealth/OMOPVocabMapper.jl#14 · 2 条评论 · 2026年2月4日创建
Support for Pulseq 1.5.1 Extensions
未关闭
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enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

JuliaHealth/KomaMRI.jl#714 · 2026年1月16日创建

维护者通常 2 天内回复
[DISCUSS] Code Style and Formatting for JuliaHealth Packages
未关闭
- 哪里不对？
难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

JuliaHealth/juliahealth.github.io#72 · 2026年1月5日创建

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