Owner
Imageomics
已索引 58 个仓库 · 在 GitHub 查看
-
bioclip
This is the repository for the BioCLIP model and the TreeOfLife-10M dataset [CVPR'24 Oral, Best Student Paper].
Python · 278 个 star
-
bioclip-2
Repository for the BioCLIP 2 model project. [NeurIPS'25 Spotlight] BioCLIP 2 is a biological foundation model trained on TreeOfLife-200M....
Python · 95 个 star
-
Prompt_CAM
This is an official implementation for PROMPT-CAM: A Simpler Interpretable Transformer for Fine-Grained Analysis (CVPR'25). Explore fine-...
Jupyter Notebook · 78 个 star
-
pybioclip
Python package and CLI that simplifies using the BioCLIP family of foundation models.
Python · 67 个 star
-
saev
Sparse autoencoders for vision
Python · 66 个 star
-
Finer-CAM
This is an official implementation for Finer-CAM: Spotting the Difference Reveals Finer Details for Visual Explanation. [CVPR'25] Better ...
Jupyter Notebook · 53 个 star
-
TaxonoPy
A Python package for efficiently aligning organismal taxonomic hierarchies using the Global Names Verifier
Python · 19 个 star
-
SST
Official repo for paper "Static Segmentation by Tracking: A Frustratingly Label-Efficient Approach to Fine-Grained Segmentation". Ideal f...
Jupyter Notebook · 14 个 star
-
biobench
Computer vision benchmark for evolutionary biology-related tasks.
Python · 10 个 star
-
kabr-tools
Modular tools pipeline for annotating animal behavior. These were specifically designed during construction of the KABR dataset, and have...
Python · 10 个 star
-
catalog
Catalog app for Imageomics code, data, models, and spaces hosted on GitHub and Hugging Face. Designed for improved discoverability of Ima...
JavaScript · 10 个 star
-
phylo-diffusion
Implementation of "Hierarchical Conditioning of Diffusion Models Using Tree-of-Life for Studying Species Evolution" [ECCV 2024]
Python · 8 个 star
-
mmla
Scripts for MMLA dataset
Jupyter Notebook · 7 个 star
-
wildwing
Autonomous UAS Software for In Situ Imageomics Missions
HTML · 7 个 star
-
TreeOfLife-toolbox
Source-specific tools for processing data (images) downloaded using distributed downloader and relies on MPI.
Jupyter Notebook · 7 个 star
-
dashboard-prototype
Prototype data dashboard for Imageomics Data
Python · 6 个 star
-
wing-segmentation
Butterfly wing segmentation
Jupyter Notebook · 6 个 star
-
Imageomics-guide
Imageomics-focused guide to collaborative work, including GitHub and Hugging Face workflows.
Python · 6 个 star
-
emb-explorer
An interactive tool for classifying images with a pretrained model and exploring clustering results in 2D space.
Python · 6 个 star
-
FuncaPalooza-2025
FuncaPalooza: collaborative hands-on event for extracting functional traits from images at OSU, Aug 18-21, 2025.
5 个 star
- 还有 38 个仓库在 在 GitHub 查看
可能已有人在做的 issue 排在最后。 全部按时间排序
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
Imageomics/OpenCite#73 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 65/100
Imageomics/OpenCite#68 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 68/100
Imageomics/OpenCite#69 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 76/100
Imageomics/OpenCite#66 ·
维护者通常 1 天内回复
-
enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100
Imageomics/TaxonoPy#38 ·
-
Taxonomy columns in `dataset/catalog.parquet` are shifted incorrectly causing species to be null未关闭
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 65/100
Imageomics/TreeOfLife-toolbox#59 · 1 条评论 ·
-
bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 86/100
Imageomics/repo-exporter#81 ·
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 62/100
Imageomics/OpenCite#55 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 2/5 半天 新手友好度 75/100
Imageomics/mmla#24 · 1 条评论 ·
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 78/100
-
GitHub Hugging Face python
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 70/100
Imageomics/repo-exporter#76 ·
-
enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
Imageomics/bioclip-ecosystem#58 · 3 条评论 ·
-
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 90/100
-
enhancement GitHub
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 64/100
Imageomics/repo-exporter#75 · 2 条评论 ·
-
Adjust km^2 grid square labeling可能重新可做 @AlysonEast 于 39 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
Imageomics/SAtrEes#1 · 1 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
Limit Retry Attempts可能重新可做 @NetZissou 于 40 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭enhancement
Imageomics/bioclip-image-search-lite#44 · 1 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
-
project idea
难度 5/5 一周以上 新手友好度 30/100
Imageomics/FloraPalooza-2026#6 · 1 条评论 · 1 个 reaction ·
-
project idea
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
-
Review the website’s mobile experience可能重新可做 @chloelimputra 于 43 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
Imageomics/imageomics.github.io#11 · 1 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
dataset project idea
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
Imageomics/FloraPalooza-2026#4 · 1 个 reaction ·
-
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 88/100
Imageomics/Imageomics-guide#103 · 1 条评论 ·
-
dataset project idea
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
Imageomics/FloraPalooza-2026#3 · 1 条评论 ·
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100
Imageomics/catalog#133 ·
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 72/100
Imageomics/pybioclip#202 · 1 个 reaction ·
-
enhancement
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 55/100
Imageomics/catalog#131 · 2 条评论 ·
-
project idea
难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
Imageomics/FloraPalooza-2026#2 · 1 条评论 ·
-
dataset project idea
难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 45/100
Imageomics/sum-buddy#54 ·
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 72/100
Imageomics/bioclip#41 · 1 条评论 · 1 个 reaction ·
-
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 76/100
Imageomics/sum-buddy#51 ·
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100
Imageomics/OpenCite#47 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
Imageomics/OpenCite#46 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
Imageomics/OpenCite#45 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 52/100
Imageomics/OpenCite#44 ·
维护者通常 1 天内回复
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 50/100
Imageomics/OpenCite#43 ·
维护者通常 1 天内回复
-
Handling and testing other algorithms可能重新可做 @codedbyishika 于 81 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
Imageomics/cautious-robot#68 · 1 个 reaction · 已指派 1 人 ·
-
enhancement Hugging Face
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 72/100
Imageomics/repo-exporter#64 · 1 条评论 · 1 个 reaction ·
-
Add a bibtex button to project site可能重新可做 @egrace479 于 87 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭documentation
Imageomics/bioclip-2#31 · 已指派 1 人 ·
-
Integrate logging in RollCall可能重新可做 @codedbyishika 于 56 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
Imageomics/cautious-robot#65 · 已指派 1 人 ·
-
Integrate logging across codebase可能重新可做 @codedbyishika 于 96 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
Imageomics/cautious-robot#64 · 已指派 1 人 ·
-
Add per-cluster representative images to the precalculated app可能重新可做 @NetZissou 于 104 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭enhancement
Imageomics/emb-explorer#39 · 1 个 reaction · 已指派 1 人 ·
-
`ImageFolderDataset` is not picklable: `DataLoader(num_workers>0)` fails under the `spawn` start method (macOS/Windows)可能重新可做 @NetZissou 于 107 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭bug
Imageomics/hpc-inference#28 · 已指派 1 人 ·
-
GitHub App for HF Space Update可能重新可做 @egrace479 于 107 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭deploy
Imageomics/bioclip-image-search-lite#40 · 1 条评论 · 已指派 2 人 ·
-
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 42/100
Imageomics/OpenCite#30 ·
维护者通常 1 天内回复
-
Add provenance files可能重新可做 @AlysonEast 于 114 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭documentation
Imageomics/CarabidImaging#3 · 已指派 1 人 ·
-
bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 58/100
Imageomics/cautious-robot#57 · 1 条评论 ·
-
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 65/100
-
HF Demo Space for Precalculated Embedding App可能重新可做 @NetZissou 于 117 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭design enhancement
Imageomics/emb-explorer#31 · 6 条评论 · 已指派 1 人 ·
-
Sort outputs未关闭
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
Imageomics/sum-buddy#43 · 1 个 reaction ·
只显示最新的 100 条
这个页面只列出最近收录的部分。完整清单在高级筛选里，可以按语言、难度和预计耗时筛选。