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YeoLab 的倉庫

Python Templates for the PyCharm IDE

最近提交 2015年5月27日

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A program to construct SVM model and get classification scores for predicting RNA-binding proteins with given PPI network and RBP annotation list

最近提交 2022年10月3日

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:anchor: Find bimodal, unimodal, and multimodal features in your data

最近提交 2017年7月14日

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Flotilla package of Illumina bodymap data

最近提交 2014年12月10日

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:triangular_ruler: Transform percentage-based units into a 2d space to evaluate changes in distribution with both magnitude and direction.

最近提交 2017年6月29日

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最近提交 2022年5月15日

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A tool to identify CLIP-seq peaks

最近提交 2025年10月31日

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YeoLab/eCLIPCommon Workflow Language

最近提交 2022年9月29日

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demultiplex utility for eclip raw fastq files (process eclip barcodes and ramdomers)

最近提交 2021年7月16日

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YeoLab/flotillaJupyter Notebook

Reproducible machine learning analysis of gene expression and alternative splicing data

最近提交 2017年4月19日

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scrambled data for testing flotilla functionality

最近提交 2014年12月3日

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GFF and GTF file manipulation and interconversion

最近提交 2013年3月1日

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General Use Scripts and Helper functions

最近提交 2018年3月29日

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Python port of Hierarchical Covariate with Prior from Matlab code

最近提交 2014年10月25日

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Pipeline for using IDR to produce a set of peaks given two replicate eCLIP peaks

最近提交 2021年9月29日

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Getting started in the yeolab

最近提交 2020年5月29日

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Create a *de novo* alternative splicing database, validate splicing events, and quantify percent spliced-in (Psi) from RNA seq data

最近提交 2020年4月10日

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A tool to simulate CLIP-seq peaks

最近提交 2012年8月9日

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qtools has helper functions to submit jobs to compute clusters (PBS on TSCC, SGE on oolite) from within Python

最近提交 2021年9月9日

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splicing and feature maps for RBPs

最近提交 2022年4月19日

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