Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

DataFusion plans a CTE once per reference, so ML queries grow exponentially with depth

Đang mở Phù hợp với người mới
#267 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
2/5
Thời gian dự kiến
1-3 giờ
Mức phù hợp với người mới
64/100
Loại issue
Tài liệu
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Công nghệ
postgresql, python
Lĩnh vực
backend, data-engineering

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu với docs/limitations.md, nơi issue chỉ định để ghi lại việc DataFusion lập kế hoạch lặp lại cho các CTE và giải pháp thay thế là đăng ký một kết quả trung gian làm bảng. Đối chiếu hành vi được ghi lại với giới hạn được báo cáo trong DataFusion 54 và giải thích rằng hỗ trợ CTE được materialize và các quyết định tự động là công việc ở upstream. Hoàn thành khi người đọc có thể hiểu giới hạn và xác định giải pháp thay thế.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

enhancement

DataFusion plans a CTE once for every place that reads it, so a query whose CTEs read earlier CTEs more than once grows exponentially with its depth. DuckDB computes such a CTE once. ML models written in SQL hit this constantly: a layer norm reads its input three times, a residual connection twice, and a message-passing round reads the node states as sender, receiver and residual.

Reproduction

Each CTE joins the previous one with itself:

from datafusion import SessionContext

def query(depth):
    ctes = ["c0 AS (SELECT i, x FROM t)"] + [
        f"c{d} AS (SELECT a.i, a.x + b.x AS x FROM c{d-1} a JOIN c{d-1} b ON a.i = b.i)"
        for d in range(1, depth + 1)
    ]
    return f"WITH {', '.join(ctes)} SELECT SUM(x) FROM c{depth}"

ctx = SessionContext()
ctx.sql("CREATE TABLE t AS SELECT * FROM (VALUES (1, 1.0), (2, 2.0)) v(i, x)").collect()
plan = ctx.sql(query(8)).execution_plan().display_indent()
depth DataFusion operators DataFusion table scans DuckDB 1.5.5 operators
2 16 4 13
4 64 16 23
6 256 64 33
8 1,024 256 43

In the ML benchmarks

The same queries, on DataFusion 54.0.0 through xarray_sql.Context and on DuckDB through xql.register, Intel i7-8700:

Query DataFusion operators DuckDB operators DataFusion DuckDB
1-layer GPT loss, batch 4 (112 lines of SQL) 12,166 120 8.4 s 0.055 s
GraphCast-shaped forecast, 1 processor round 1,816 243 43 s 17 s
GraphCast-shaped forecast, 2 processor rounds 5,948 282 159 s 13 s

A table read through xarray-sql is read again for every inlined copy. With ERA5 registered lazily from GCS, the 1-round forecast spent most of its time waiting on the network, so the benchmark loads its three time steps into memory first.

A training step through ddx (forward and backward) takes 2.7 s on DataFusion, less than the 8.4 s forward query alone, because ddx stores each step of its program as a table.

Upstream

DataFusion is working on this. apache/datafusion#25580 added WITH ... AS MATERIALIZED, in the PostgreSQL dialect only (apache/datafusion#17737), and apache/datafusion#26237 proposes deciding automatically, as PostgreSQL and DuckDB do. Neither is in DataFusion 54.

Options for xarray-sql

  • Once a DataFusion release has AS MATERIALIZED, check that it works with xarray-sql's table providers and the datafusion dialect Context uses, and document it.
  • Follow apache/datafusion#26237, which would fix this without changing queries.
  • Until then, document the behavior in docs/limitations.md, with the workaround: register an intermediate result as a table.
Ngôn ngữ chính
Python
Star
142
Fork
19
Merge trung bình
1 ngày 9 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
10

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của xqlsystems/xarray-sql

Tất cả issue của xqlsystems/xarray-sql

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.