Installation failure with 'pak' - invalid binary

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#416 2 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
35/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
linux, r, ubuntu
Lĩnh vực
build-system, tooling

Hướng nghiên cứu

Start by reproducing the pak::pkg_install("devtools") command on Ubuntu and inspect the cached httpuv_1.6.16.tar.gz alongside the verify_extracted_package failure in the reported backtrace. Trace whether the artifact is produced or selected by this repository or by pak; done means the installation path no longer rejects the httpuv package as a missing Meta/package.rds binary.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

I'm getting a failure trying to install devtools on Ubuntu using pak, it points to an invalid binary httpuv package:

# /opt/R/4.0.5/bin/Rscript -e 'pak::pkg_install("devtools")'
v Loading metadata database ... done
 
> Will install 37 packages.
> All 37 packages (0 B) are cached.
+ Rcpp          1.0.14  
+ httpuv        1.6.16   + v make, v zlib1g-dev
+ pillar        1.10.2  
+ pkgbuild      1.4.7   
+ pkgconfig     2.0.3   
+ pkgdown       2.1.1    + v pandoc
+ pkgload       1.4.0   
+ praise        1.0.0   
+ prettyunits   1.2.0   
+ processx      3.8.6   
+ profvis       0.4.0   
+ promises      1.3.2   
+ ps            1.9.1   
+ ragg          1.4.0    + v libfreetype6-dev, v libjpeg-dev, v libpng-dev, v libtiff-dev
+ rcmdcheck     1.4.0   
+ remotes       2.5.0    + v git
+ rmarkdown     2.29     + v pandoc
+ roxygen2      7.3.2   
+ rversions     2.1.2   
+ sass          0.4.10   + v make
+ sessioninfo   1.2.3   
+ shiny         1.10.0  
+ sourcetools   0.1.7-1 
+ stringi       1.8.7    + v libicu-dev
+ stringr       1.5.1   
+ systemfonts   1.2.2    + v libfontconfig1-dev, v libfreetype6-dev
+ testthat      3.2.3   
+ textshaping   1.0.0    + v libfreetype6-dev, v libfribidi-dev, v libharfbuzz-dev
+ tibble        3.2.1   
+ tinytex       0.57    
+ urlchecker    1.0.1   
+ utf8          1.2.4   
+ waldo         0.6.1   
+ xfun          0.52    
+ xml2          1.3.8    + v libxml2-dev
+ xopen         1.0.1   
+ xtable        1.8-4   
v All system requirements are already installed.
  
i No downloads are needed, 37 pkgs are cached
v Got ragg 1.4.0 (x86_64-pc-linux-gnu-ubuntu-24.04) (431.17 kB)
v Got tinytex 0.57 (x86_64-pc-linux-gnu-ubuntu-24.04) (36.58 kB)
v Got ps 1.9.1 (x86_64-pc-linux-gnu-ubuntu-24.04) (168.75 kB)
v Got sass 0.4.10 (x86_64-pc-linux-gnu-ubuntu-24.04) (3.03 MB)
v Got httpuv 1.6.16 (x86_64-pc-linux-gnu-ubuntu-24.04) (1.90 MB)
v Installed pillar 1.10.2  (109ms)
v Installed pkgbuild 1.4.7  (157ms)
v Installed pkgconfig 2.0.3  (180ms)
Error: 
! error in pak subprocess
Caused by error in `verify_extracted_package(filename, pkg_cache)`:
! /tmp/Rtmp4yPD2c/file4621a206b85/src/contrib/x86_64-pc-linux-gnu-ubuntu-24.04/4.0/httpuv_1.6.16.tar.gz is not a valid binary, it is missing httpuv/Meta/package.rds.
---
Backtrace:
1. pak::pkg_install("devtools")
2. pak:::remote(function(...) get("pkg_install_do_plan", asNamespace("pak"))(...), ...
3. err$throw(res$error)
---
Subprocess backtrace:
 1. base::withCallingHandlers(cli_message = function(msg) { ...
 2. get("pkg_install_do_plan", asNamespace("pak"))(...)
 3. proposal$install()
 4. pkgdepends::install_package_plan(plan, lib = private$library, num_workers = nw, ...
 5. base::withCallingHandlers({ ...
 6. pkgdepends:::handle_events(state, events)
 7. pkgdepends:::handle_event(state, i)
 8. proc$get_result()
 9. processx:::process_get_result(self, private)
10. private$post_process()
11. pkgdepends:::install_extracted_binary(filename, lib_cache, pkg_cache, lib, ...
12. pkgdepends:::verify_extracted_package(filename, pkg_cache)
13. base::throw(pkg_error("{.path {filename}} is not a valid binary, it is missing {miss}.", ...
14. | base::signalCondition(cond)
15. global (function (e) ...
Execution halted

Looking at the .tar.gz file, it does indeed seem to be a source distribution instead of a binary, so I'm not sure whether this is a problem with the artifact itself or with pak. I did upgrade pak to version 0.8.0.2 and the problem persists, though.

Any advice?

Ngôn ngữ chính
C
Star
252
Fork
87
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của rstudio/httpuv

Tất cả issue của rstudio/httpuv

Issue tương tự

Thêm issue về C

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.