Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

pandas 2.2.3 import fails with RuntimeError on GraalPy 25.0.2

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#944 2 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
45/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Ít trao đổi
Công nghệ
numpy, pandas, python
Lĩnh vực
devtools

Hướng nghiên cứu

Tái hiện lỗi bằng Dockerfile và các lệnh được cung cấp, sau đó bắt đầu từ pandas._libs.tslibs.dtypes, được xác định trong traceback là dtypes.pyx trong quá trình import. Theo dõi quá trình khởi tạo gây ra lỗi kích thước dictionary và xác minh rằng công việc hoàn tất khi lệnh python -c \"import pandas\" được cung cấp chạy thành công trên GraalPy 25.0.2.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

bug python
Description

On Linux with GraalPy 25.0.2, a pandas wheel built from source installs successfully but fails on import with:

RuntimeError: dictionary changed size during iteration

The reporter used:

  • GraalPy 25.0.2
  • Linux x86_64
  • numpy 2.2.6
  • pandas 2.2.3
Traceback
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
  File "/home/user/Desktop/venv/lib/python3.12/site-packages/pandas/__init__.py", line 49, in <module>
    from pandas.core.api import (
  File "/home/user/Desktop/venv/lib/python3.12/site-packages/pandas/core/api.py", line 1, in <module>
    from pandas._libs import (
  File "/home/user/Desktop/venv/lib/python3.12/site-packages/pandas/_libs/__init__.py", line 18, in <module>
    from pandas._libs.interval import Interval
  File "interval.pyx", line 1, in init pandas._libs.interval
  File "hashtable.pyx", line 1, in init pandas._libs.hashtable
  File "missing.pyx", line 1, in init pandas._libs.missing
  File "/home/user/Desktop/venv/lib/python3.12/site-packages/pandas/_libs/tslibs/__init__.py", line 39, in <module>
    from pandas._libs.tslibs import dtypes  # pylint: disable=import-self
  File "dtypes.pyx", line 172, in init pandas._libs.tslibs.dtypes
RuntimeError: dictionary changed size during iteration
Dockerfile Used To Build Wheels
FROM --platform=linux/amd64 amazonlinux:2023
USER root
ARG GRAALPY_VERSION=25.0.2
ARG ARCH=amd64
RUN dnf update -y && \
    dnf install -y \
    wget tar gzip unzip patchelf gcc gcc-c++ patch git \
    gcc-gfortran openblas-devel zlib-devel libjpeg-turbo-devel \
    libxml2-devel libxslt-devel && \
    dnf clean all
RUN wget https://github.com/oracle/graalpython/releases/download/graal-${GRAALPY_VERSION}/graalpy-${GRAALPY_VERSION}-linux-${ARCH}.tar.gz && \
    tar -xzf graalpy-${GRAALPY_VERSION}-linux-${ARCH}.tar.gz -C /opt/ && \
    rm graalpy-${GRAALPY_VERSION}-linux-${ARCH}.tar.gz
ENV PATH="/opt/graalpy-${GRAALPY_VERSION}-linux-${ARCH}/bin:$PATH"
RUN graalpy -m ensurepip --default-pip && \
    graalpy -m pip install --upgrade pip auditwheel setuptools wheel && \
    graalpy -m pip install meson-python ninja cython pyproject-metadata setuptools-scm pybind11
WORKDIR /workspace
CMD ["/bin/bash", "-c", "\
    graalpy -m pip wheel numpy --no-binary numpy -w /workspace && \
    graalpy -m auditwheel repair /workspace/numpy-*.whl -w /workspace/wheelhouse && \
    graalpy -m pip install /workspace/wheelhouse/numpy-*.whl && \
    graalpy -m pip wheel pandas --no-binary pandas --find-links /workspace/wheelhouse -w /workspace && \
    graalpy -m auditwheel repair /workspace/pandas-*.whl -w /workspace/wheelhouse && \
    cp /workspace/wheelhouse/*.whl /out \
"]
# docker build -t libs .
# docker run --rm -v "$PWD":/out --cpus="2" --memory="15g" --memory-swap="15g" libs
Steps To Reproduce
graalpy -m venv venv
source venv/bin/activate
docker build -t libs .
docker run --rm -v "$PWD":/out --cpus="2" --memory="15g" --memory-swap="15g" libs
pip install numpy*.whl pandas*.whl
python -c "import pandas"
Expected Behavior

import pandas succeeds.

Actual Behavior

import pandas raises RuntimeError: dictionary changed size during iteration during initialization of pandas._libs.tslibs.dtypes.

Ngôn ngữ chính
Python
Star
1.7k
Fork
155
Merge trung bình
6 giờ 28 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
49

Chuẩn bị môi trường

Mở trong Codespaces

Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của oracle/graalpython

Tất cả issue của oracle/graalpython

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.