Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

[Bug]: JVM crash (SIGSEGV in Py_REFCNT) on numpy.frombuffer(memoryview(java.nio.ByteBuffer))

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#1,198 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
44/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Công nghệ
java, numpy, python
Lĩnh vực
backend

Hướng nghiên cứu

Start by reproducing the failure with the provided numpy.frombuffer(memoryview(buffer)) example under GraalPy, then trace how Java ByteBuffer memoryviews are exposed to C extensions and how the buffer protocol reaches NumPy. The issue does not name relevant source files or tests, so finding the responsible interop path will take codebase exploration. Done means the example returns a valid four-element array or raises a Python exception instead of crashing the JVM.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Describe the bug

Calling numpy.frombuffer on a memoryview of a Java java.nio.ByteBuffer crashes the JVM with SIGSEGV in Py_REFCNT (libpython-native.so). A Python-level error, or a working zero-copy view, would be expected.

Operating system

Linux (NixOS), kernel 6.18

CPU architecture

x86_64

GraalPy version

25.4.4 (python-language 25.4.4.1.1, embedded via Micronaut/Pyronaut)

JDK version

GraalVM CE 25.4.4.1.1 (JDK 25.0.4)

Context configuration

Embedded context built by Micronaut's GraalPyContextFactory (Pyronaut 0.1.0): allowNativeAccess(true), allowHostAccess(...), allowHostClassLookup(...), allowValueSharing(true), allowPolyglotAccess(ALL), the java posix backend, and a venv with numpy 2.4.4 from the GraalPy wheel index (numpy-2.4.4-graalpy313-graalpy253_313_native-manylinux_2_27_x86_64.whl).

Steps to reproduce
import numpy as np
from java.nio import ByteBuffer, ByteOrder

buffer = ByteBuffer.allocate(16).order(ByteOrder.LITTLE_ENDIAN)
print(np.frombuffer(memoryview(buffer), dtype="<f4"))  # JVM dies here

This was run as a pytest test under pyronaut test. It crashes on every run.

Expected behavior

Either a 4-element float32 array, sharing or copying the buffer's memory, or a Python exception if host buffers can't be exported through the buffer protocol to C extensions.

Stack trace
#  SIGSEGV (0xb) at pc=0x00007fff79ad2db5, pid=174452, tid=174453
# Problematic frame:
# C  [libpython-native.so+0x23db5]  Py_REFCNT+0x5

C  [libpython-native.so+0x23db5]  Py_REFCNT+0x5
j  java.lang.invoke.LambdaForm$MH+0x0000000064e44c00.invoke(Ljava/lang/Object;JJJJ)J+64 [email protected]
j  com.oracle.graal.python.builtins.objects.cext.capi.ExternalFunctionInvoker.invokePYCFUNCTION_WITH_KEYWORDS(JJJJ)J+9
j  com.oracle.graal.python.builtins.objects.cext.capi.ExternalFunctionInvoker.invokePYCFUNCTION_WITH_KEYWORDS(...)
j  com.oracle.graal.python.builtins.objects.cext.capi.ExternalFunctionNodes$MethKeywordsRoot.readArgumentsAndInvokeExternalFunction(...)
j  com.oracle.graal.python.builtins.objects.PythonAbstractObject$PExecuteNode.doExecute(...)
Additional context

Related: np.asarray(java_float_array) on a Java float[] fails with RecursionError: maximum recursion depth exceeded. As a result there is currently no efficient way to move a large Java primitive array into numpy. Our workaround is to write the data to a file from Java and np.frombuffer(f.read()) it in Python.

Ngôn ngữ chính
Python
Star
1.7k
Fork
156
Merge trung bình
4 giờ 56 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
54

Chuẩn bị môi trường

Mở trong Codespaces

Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của oracle/graalpython

Tất cả issue của oracle/graalpython

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.