quantiles drawn by geom_violin's draw_quantiles option are incorrect

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#847 3 bình luận 1 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
45/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
python
Lĩnh vực
data-visualization

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách tái hiện ví dụ Python được cung cấp bằng geom_violin(draw_quantiles=[0.25, 0.5, 0.75]) và geom_boxplot được chồng lên. Theo dõi hành vi draw_quantiles của geom_violin và so sánh các đường của nó với các giá trị 25%, 50% và 75% của dữ liệu được nhóm. Được xem là hoàn tất khi các đường phân vị của violin trùng với các phân vị thống kê tương ứng, bao gồm cả trung vị.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Discussion

The quantiles drawn by geom_violin are incorrect e.g. the 50% quantile does not correspond to the median. A simple example, where a boxplot is overlayed to show the expected position of the 25, 50 and 75% quantiles:

from plotnine import *
import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame({
    "y": np.random.gamma(1,2,10),
    "x": ["a"]*10
})
plt = (
    ggplot(df, aes(x="x", y="y")) +
    geom_violin(draw_quantiles=[0.25,0.5,0.75]) +
    geom_boxplot(alpha=0.5,width=0.1,fill="grey")
)
plt.show()

Plotting the mean and median for comparison:

plt = (
    ggplot(df, aes(x="x", y="y")) +
    geom_violin(draw_quantiles=0.5) +
    geom_hline(data=df.groupby(["x"])["y"].describe(), mapping=aes(yintercept="mean"), color="red",alpha=0.5) +
    geom_hline(data=df.groupby(["x"])["y"].describe(), mapping=aes(yintercept="50%"), color="blue",alpha=0.5)
)
plt.show()

Tested with plotnine-0.13.6 and Python 3.10

Ngôn ngữ chính
Python
Star
4.8k
Fork
260
Merge trung bình
2 ngày 12 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
4

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của has2k1/plotnine

Tất cả issue của has2k1/plotnine

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.