[Bug]: `integration switch` leaves the manifest out of date when a preset overrides a core command

Đang mở Phù hợp với người mới
#5,078 1 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
2/5
Thời gian dự kiến
1-3 giờ
Mức phù hợp với người mới
78/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Đặc tả rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Công nghệ
python
Lĩnh vực
cli

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu với src/specify_cli/integrations/command_switch.py:380-389 và so sánh luồng đăng ký preset của nó với _resync_manifest_after_registration trong command_upgrade.py:352 và src/specify_cli/integrations/_helpers.py:486-505. Chạy thao tác tái hiện trong issue và kiểm tra tests/specify_cli/integrations/test_command_upgrade.py:1320-1385 để xem kỳ vọng hồi quy hiện có. Công việc hoàn tất khi hash của manifest khớp với tệp preset đã được viết lại sau khi chuyển đổi và lần nâng cấp tiếp theo thành công mà không cần --force.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

bug-assess invalid triage-must-have
Bug Description

specify integration switch <target> installs the target integration and saves its manifest (src/specify_cli/integrations/command_switch.py:309-316). It then re-registers installed presets for the target (command_switch.py:380-389). A preset that overrides a core command rewrites a file the manifest already tracks, and the manifest is not re-hashed afterwards. As a result integration status reports the file as modified, and a later integration upgrade without --force refuses to run, even though the user changed nothing.

integration upgrade handles the same situation by calling _resync_manifest_after_registration (command_upgrade.py:352, added for #4696). switch does not call it.

Steps to Reproduce

From the root of a fresh clone, after uv sync, save the script below as repro.py and run it with uv run python repro.py.

import hashlib, json, os, tempfile
from pathlib import Path
from typer.testing import CliRunner
from specify_cli import app

tmp = Path(tempfile.mkdtemp())
project = tmp / "proj"
project.mkdir()
os.chdir(project)
run = lambda *args: CliRunner().invoke(app, list(args))

run("init", "--here", "--integration", "claude", "--script", "sh", "--ignore-agent-tools")

preset = tmp / "tasks-preset"
(preset / "commands").mkdir(parents=True)
(preset / "commands" / "speckit.tasks.md").write_text(
    "---\ndescription: Tasks override\n---\nPreset tasks body\n")
(preset / "preset.yml").write_text("""schema_version: '1.0'
preset: {id: tasks-preset, name: Tasks Preset, version: 1.0.0, description: x}
requires: {speckit_version: '>=0.1.0'}
provides:
  templates:
  - {type: command, name: speckit.tasks, file: commands/speckit.tasks.md}
""")
run("preset", "add", "--dev", str(preset))

r = run("integration", "switch", "codex", "--script", "sh")
print("switch exit code:", r.exit_code)

rel = ".agents/skills/speckit-tasks/SKILL.md"
manifest = json.loads(Path(".specify/integrations/codex.manifest.json").read_text())
on_disk = hashlib.sha256(Path(rel).read_bytes()).hexdigest()
print("preset body in skill:", "Preset tasks body" in Path(rel).read_text())
print("manifest hash matches file:", manifest["files"][rel] == on_disk)

r = run("integration", "upgrade", "codex", "--script", "sh")
print("upgrade exit code:", r.exit_code)
print(r.output.strip())

The script initialises a project with Claude Code, adds a local preset that overrides speckit.tasks, switches to Codex, compares the manifest hash with the file on disk, and then runs integration upgrade codex without --force.

Expected Behavior

After the switch, the manifest hash for .agents/skills/speckit-tasks/SKILL.md matches the file that preset registration wrote, and integration upgrade codex succeeds. The docstring of _resync_manifest_after_registration (src/specify_cli/integrations/_helpers.py:486-505) says files rewritten by registration must be re-hashed "so check_modified() doesn't misreport a legitimate override as tampering", and names switch among the operations it serves. The regression test test_upgrade_force_syncs_manifest_hash_for_preset_overridden_skill (tests/specify_cli/integrations/test_command_upgrade.py:1320-1385) sets the same expectation for upgrade.

Actual Behavior
switch exit code: 0
preset body in skill: True
manifest hash matches file: False
upgrade exit code: 1
⚠  1 file(s) have been modified since installation:
    .agents/skills/speckit-tasks/SKILL.md

Use --force to overwrite modified files, or resolve manually.
Specify CLI Version

1.2.4.dev0 (main at 27d14e2)

AI Agent

Codex CLI

Operating System

Linux 6.18 (Ubuntu container)

Python Version

Python 3.12.3

Error Logs
⚠  1 file(s) have been modified since installation:
    .agents/skills/speckit-tasks/SKILL.md

Use --force to overwrite modified files, or resolve manually.
Additional Context

integration use (src/specify_cli/integrations/command_use.py) also re-registers presets without a manifest resync, so it looks affected in the same way, but I have not reproduced that path. Calling _resync_manifest_after_registration after preset registration in switch (and probably use) would likely fix it.

Also reproduced on macOS (Darwin 25.6, arm64) with Python 3.14.4 and uv run python -I repro.py against 27d14e2; the output matches the above.

AI Disclosure

Found and reproduced with Claude Code (model: Claude Opus 4.8), run autonomously under human supervision. The human reporter re-ran every reproduction above before filing.

Ngôn ngữ chính
Python
Star
149k
Fork
13.4k
Merge trung bình
1 ngày 5 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
223

Chuẩn bị môi trường

Mở trong Codespaces

Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của github/spec-kit

Tất cả issue của github/spec-kit

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.