Vignette information on how to use codelistgenerator locally

Đang mở
#240 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
45/100
Loại issue
Tài liệu
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
r
Lĩnh vực
documentation

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách xem xét các vignettes hiện có của package và các entry point cho việc sử dụng cục bộ so với sử dụng trên server. Ghi lại một workflow cục bộ rõ ràng để tạo codelists với các vocabulary như ICD-O-3, bao gồm những gì người dùng cần cấu hình và cách xác minh rằng các code được yêu cầu đã được tìm thấy.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Is your feature request related to a problem? Please describe.
I want to run codelistgenerator locally but dont know how to do it

Describe the solution you'd like
A clear and concise description of an example on how to do it locally

Describe alternatives you've considered
Do it on the server however if my database does not have that vocab i need i potentially will miss codes i need for my study

Additional context
I am working on a federated cancer study where i need codelists for different cancers. The other data partners include primary care, secondary and cancer registry. I only have acccess to primary care therefore my database does not have vocabs for standard cancer i.e. ICD-0-3 which i need if i want to run my study in a cancer registry which uses this vocabs ontop of snomed.

Ngôn ngữ chính
R
Star
18
Fork
9
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của darwin-eu/CodelistGenerator

Tất cả issue của darwin-eu/CodelistGenerator

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.