nnunetv2 support for numpy >=2.0
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 38/100
- Loại issue
- Lỗi
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- numpy, python, pytorch
- Lĩnh vực
- machine-learning, testing-qa
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu bằng cách chạy tests/integration/test_integration_nnunetv2_runner.py và kiểm tra đường dẫn import được hiển thị trong traceback. Theo dõi lỗi tương thích của NumPy xuyên suốt phần thiết lập tích hợp nnUNetV2; được xem là hoàn tất khi bài kiểm thử tích hợp này chạy thành công với NumPy 2.x mà không có cảnh báo khởi tạo đã được báo cáo.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
[2025-05-01T13:49:17.542Z] + python -m tests.integration.test_integration_nnunetv2_runner
[2025-05-01T13:49:18.474Z]
[2025-05-01T13:49:18.474Z] A module that was compiled using NumPy 1.x cannot be run in
[2025-05-01T13:49:18.474Z] NumPy 2.2.5 as it may crash. To support both 1.x and 2.x
[2025-05-01T13:49:18.474Z] versions of NumPy, modules must be compiled with NumPy 2.0.
[2025-05-01T13:49:18.474Z] Some module may need to rebuild instead e.g. with 'pybind11>=2.12'.
[2025-05-01T13:49:18.474Z]
[2025-05-01T13:49:18.474Z] If you are a user of the module, the easiest solution will be to
[2025-05-01T13:49:18.474Z] downgrade to 'numpy<2' or try to upgrade the affected module.
[2025-05-01T13:49:18.474Z] We expect that some modules will need time to support NumPy 2.
[2025-05-01T13:49:18.474Z]
[2025-05-01T13:49:18.474Z] Traceback (most recent call last): File "/usr/lib/python3.10/runpy.py", line 196, in _run_module_as_main
[2025-05-01T13:49:18.474Z] return _run_code(code, main_globals, None,
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/lib/python3.10/runpy.py", line 86, in _run_code
[2025-05-01T13:49:18.474Z] exec(code, run_globals)
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/home/jenkins/agent/workspace/Monai-notebooks/MONAI/tests/integration/test_integration_nnunetv2_runner.py", line 21, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from monai.apps.nnunet import nnUNetV2Runner
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/home/jenkins/agent/workspace/Monai-notebooks/MONAI/monai/__init__.py", line 83, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from .utils.module import load_submodules # noqa: E402
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/home/jenkins/agent/workspace/Monai-notebooks/MONAI/monai/utils/__init__.py", line 16, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from .deprecate_utils import DeprecatedError, deprecated, deprecated_arg, deprecated_arg_default
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/home/jenkins/agent/workspace/Monai-notebooks/MONAI/monai/utils/deprecate_utils.py", line 22, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from monai.utils.module import version_leq
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/home/jenkins/agent/workspace/Monai-notebooks/MONAI/monai/utils/module.py", line 30, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] import torch
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/__init__.py", line 2479, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from torch import (
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/export/__init__.py", line 64, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from .dynamic_shapes import Constraint, Dim, dims, ShapesCollection
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/export/dynamic_shapes.py", line 22, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from .exported_program import ExportedProgram
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/export/exported_program.py", line 27, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from torch._higher_order_ops.utils import autograd_not_implemented
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/_higher_order_ops/__init__.py", line 1, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] from torch._higher_order_ops.cond import cond
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/_higher_order_ops/cond.py", line 6, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] import torch._subclasses.functional_tensor
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/_subclasses/functional_tensor.py", line 44, in <module>
[2025-05-01T13:49:18.474Z] class FunctionalTensor(torch.Tensor):
[2025-05-01T13:49:18.474Z] File "/usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/_subclasses/functional_tensor.py", line 271, in FunctionalTensor
[2025-05-01T13:49:18.474Z] cpu = _conversion_method_template(device=torch.device("cpu"))
[2025-05-01T13:49:18.474Z] /usr/local/lib/python3.10/dist-packages/torch/_subclasses/functional_tensor.py:271: UserWarning: Failed to initialize NumPy: _ARRAY_API not found (Triggered internally at /opt/pytorch/pytorch/torch/csrc/utils/tensor_numpy.cpp:84.)
[2025-05-01T13:49:18.474Z] cpu = _conversion_method_template(device=torch.device("cpu"))
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 2.5k
- Fork
- 803
- Merge trung bình
- 6 ngày 22 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 3
Hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của Project-MONAI/tutorials
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 92/100
Project-MONAI/tutorials#2076 · 2 bình luận ·
-
Độ khó 1/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 76/100
Project-MONAI/tutorials#2069 ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
Project-MONAI/tutorials#1704 ·
-
Rehost CONSep Đang mở
Project-MONAI/tutorials#2079 · 2 người được giao ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 62/100
Project-MONAI/tutorials#2071 ·
Tất cả issue của Project-MONAI/tutorials
Issue tương tự
-
bug good first issue multicut serialization
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
-
bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
-
feat(dictionary): add benign in-frame MUC1 events so benchmarks can score benign-event specificity Đang mởenhancement
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
berntpopp/MucOneSpan#69 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
stanfordnlp/dspy#10485 ·
-
Mnist Web Inference error Đang mở
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 90/100