Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

Memory Exception When Merging Large Volumes of Waveform Data Files Using wrdb.wrsamp()

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#464 2 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
25/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
python
Lĩnh vực
data-engineering

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách tái hiện ngoại lệ bộ nhớ đã được báo cáo với wrdb.wrsamp() trên nhiều tệp .dat và kiểm tra cách luồng đọc, kết hợp và ghi hiện tại xử lý các mảng. Được xem là hoàn thành khi xác định được việc ghi tăng dần có được hỗ trợ hay không, đồng thời xác định phần triển khai và bài kiểm thử hồi quy cần thiết nếu không được hỗ trợ; issue không nêu tên tệp hoặc bài kiểm thử nào.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

I'm trying to merge multiple waveform data (.dat) files into a single file. I'm using the wrdb.wrsamp() function for this task. The total number of files is approximately 10,000 and each one has 3 channels. I've tried several times, but every attempt results in a memory exception, requiring more than 40GB of memory. I'm unsure if I am doing something incorrect.

I've been unable to find a method to write the files incrementally. My current approach is to read each sample, combine all signals into an array, and write them. While this works fine with a small number of files, I'm having difficulties when it comes to larger datasets. Each file contains over 6 minutes of data.

Any assistance insights or suggestions on this matter would be highly appreciated.

Ngôn ngữ chính
Jupyter Notebook
Star
853
Fork
322
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Chúng tôi chưa kiểm tra các tệp thiết lập môi trường của dự án này. Hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của MIT-LCP/wfdb-python

Tất cả issue của MIT-LCP/wfdb-python

Issue tương tự

Thêm issue về Data Engineering

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.