Process Error when using julia in python
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 25/100
Hướng nghiên cứu
Tái hiện lỗi import với Julia 1.4.1 và Python 3.8.10 trên Ubuntu 20.04 trong WSL2. Bắt đầu với julia/install.jl, julia/core.py và julia/juliainfo.py, sau đó tham khảo trang khắc phục sự cố của PyJulia về cảnh báo libpython đã được báo cáo. Công việc được xem là hoàn tất khi xác định được nguyên nhân khiến tiến trình con Julia thoát với giá trị khác không và ghi lại một cách giải quyết đã được xác minh.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Hello together,
I want to use the DifferentialEquations julia module in python via PyJulia.
So I tried to get julia and PyJulia running.
I have installed Julia versions 1.4.1 and Python version 3.8.10.
But when I try to use any julia module, for example with the following code:
import julia
julia.install()
from julia import Base
I always get the following log-output with error message:
[ Info: Julia version info
Julia Version 1.4.1
Platform Info:
OS: Linux (x86_64-linux-gnu)
Ubuntu 20.04.3 LTS
uname: Linux 5.10.16.3-microsoft-standard-WSL2 #1 SMP Fri Apr 2 22:23:49 UTC 2021 x86_64 x86_64
CPU: Intel(R) Core(TM) i7-10510U CPU @ 1.80GHz:
speed user nice sys idle irq
#1 2304 MHz 11102 s 109 s 2904 s 1807437 s 0 s
#2 2304 MHz 10488 s 21 s 2898 s 1698775 s 0 s
#3 2304 MHz 12425 s 77 s 3045 s 1806027 s 0 s
#4 2304 MHz 7958 s 137 s 2933 s 1701791 s 0 s
#5 2304 MHz 7714 s 93 s 2768 s 1701425 s 0 s
#6 2304 MHz 4788 s 99 s 2038 s 1815790 s 0 s
#7 2304 MHz 10981 s 65 s 3585 s 1697422 s 0 s
#8 2304 MHz 5493 s 25 s 2182 s 1815091 s 0 s
Memory: 7.670402526855469 GB (4687.16015625 MB free)
Uptime: 19332.0 sec
Load Avg: 0.15283203125 0.2890625 0.91845703125
WORD_SIZE: 64
LIBM: libopenlibm
LLVM: libLLVM-8.0.1 (ORCJIT, skylake)
Environment:
HOME = /home/vinc777
TERM = xterm-color
PATH = /bin:/home/vinc777/.vscode-server/bin/dfd34e8260c270da74b5c2d86d61aee4b6d56977/bin/remote-cli:/home/vinc777/.local/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/usr/lib/wsl/lib:/mnt/c/Program Files/copasi.org/COPASI 4.34.251/bin:/mnt/c/WINDOWS/system32:/mnt/c/WINDOWS:/mnt/c/WINDOWS/System32/Wbem:/mnt/c/WINDOWS/System32/WindowsPowerShell/v1.0/:/mnt/c/WINDOWS/System32/OpenSSH/:/mnt/c/Program Files/MATLAB/R2020b/bin:/mnt/c/Program Files/Git/cmd:/mnt/c/Program Files/TortoiseSVN/bin:/mnt/c/Users/User/AppData/Local/Microsoft/WindowsApps:/mnt/c/Users/User/AppData/Local/Programs/MiKTeX/miktex/bin/x64/:/mnt/c/Users/User/AppData/Local/GitHubDesktop/bin:/mnt/c/Users/User/AppData/Local/Programs/Microsoft VS Code/bin:/snap/bin
[ Info: Julia executable: /usr/bin/julia
[ Info: Trying to import PyCall...
┌ Warning: PyCall is already installed. However, you may have trouble using
│ this Python executable because it is statically linked to libpython.
│
│ For more information, see:
│ [https://pyjulia.readthedocs.io/en/latest/troubleshooting.html]()
│
│ Python executable:
│ /bin/python3
│ Julia executable:
│ /usr/bin/julia
└ @ Main ~/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/install.jl:90
---------------------------------------------------------------------------
CalledProcessError Traceback (most recent call last)
/home/vinc777/masterthesis/two_variant_model/pyjulia/pyjulia.ipynb Cell [1](vscode-notebook-cell://wsl%2Bubuntu/home/vinc777/masterthesis/two_variant_model/pyjulia/pyjulia.ipynb#ch0000000vscode-remote?line=0)' in <module>
1[ import julia
]()[2](vscode-notebook-cell://wsl%2Bubuntu/home/vinc777/masterthesis/two_variant_model/pyjulia/pyjulia.ipynb#ch0000000vscode-remote?line=1)[ julia.install()
----> ]()[3](vscode-notebook-cell://wsl%2Bubuntu/home/vinc777/masterthesis/two_variant_model/pyjulia/pyjulia.ipynb#ch0000000vscode-remote?line=2)[ from julia import Base
File <frozen importlib._bootstrap>:991, in _find_and_load(name, import_)
File <frozen importlib._bootstrap>:975, in _find_and_load_unlocked(name, import_)
File <frozen importlib._bootstrap>:655, in _load_unlocked(spec)
File <frozen importlib._bootstrap>:618, in _load_backward_compatible(spec)
File ~/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py:248, in JuliaModuleLoader.load_module(self, fullname)
]()[245](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=244)[ if juliapath == 'Main':
]()[246](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=245)[ return sys.modules.setdefault(fullname,
]()[247](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=246)[ JuliaMainModule(self, fullname))
--> ]()[248](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=247)[ elif self.julia.isafunction(juliapath):
]()[249](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=248)[ return self.julia.eval(juliapath)
]()[251](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=250)[ try:
File ~/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py:239, in JuliaModuleLoader.julia(self)
]()[237](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=236)[ @property
]()[238](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=237)[ def julia(self):
--> ]()[239](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=238)[ self.__class__.julia = julia = Julia()
]()[240](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=239)[ return julia
File ~/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py:468, in Julia.__init__(self, init_julia, jl_init_path, runtime, jl_runtime_path, debug, **julia_options)
]()[466](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=465)[ self.api = get_libjulia()
]()[467](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=466)[ elif init_julia:
--> ]()[468](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=467)[ jlinfo = JuliaInfo.load(runtime)
]()[469](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=468)[ if jlinfo.version_info < (0, 7):
]()[470](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/core.py?line=469)[ raise RuntimeError("PyJulia does not support Julia < 0.7 anymore")
File ~/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py:87, in JuliaInfo.load(cls, julia, **popen_kwargs)
]()[83](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=82)[ raise subprocess.CalledProcessError(
]()[84](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=83)[ retcode, [julia, "-e", "..."], output
]()[85](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=84)[ )
]()[86](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=85)[ else:
---> ]()[87](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=86)[ raise subprocess.CalledProcessError(
]()[88](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=87)[ retcode, [julia, "-e", "..."], stdout, stderr
]()[89](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=88)[ )
]()[91](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=90)[ stderr = stderr.strip()
]()[92](file:///home/vinc777/.local/lib/python3.8/site-packages/julia/juliainfo.py?line=91)[ if stderr:
CalledProcessError: Command '['julia', '-e', '...']' returned non-zero exit status 1.]()
I already tried reinstalling julia and PyCall and some suggested workarounds for similar problems but it nothing helped.
Maybe someone knows what the problem is.
Thanks
Vincent
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 893
- Fork
- 101
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của JuliaPy/pyjulia
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 20/100
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
-
Kill existing Julia sessionĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
Tất cả issue của JuliaPy/pyjulia
Issue tương tự
-
enhancement
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
epam/ai-dial-quickapps-backend#628 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
0xlau.dev 已失效,切换成 timlau.meĐang mở
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 69/100
timqian/chinese-independent-blogs#2235 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
eclipse-score/coverage_tool#27 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100
bojieli/ai-agent-book#1174 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
RedHatQE/mtv-api-tests#721 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày