SymPy.jl not threadsafe?

Đang mở

#431 mở ngày 17/6/2021 6 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó: 4/5
Thời gian dự kiến: 3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới: 30/100

Loại issue: Lỗi
Độ rõ ràng: Cần làm rõ
Mức độ hoạt động: Đình trệ
Công nghệ: julia, python
Lĩnh vực: api, backend

Hướng nghiên cứu

Tái hiện MWE Julia REPL được cung cấp bằng cách sử dụng Threads.@threads và kiểm tra ranh giới SymPy.jl/PyCall được stack trace chỉ ra. Xác định những thao tác theo luồng nào được hỗ trợ và làm cho kết quả có thể kiểm chứng thông qua một bài kiểm thử hồi quy hoặc hành vi được ghi rõ trong tài liệu.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

While working with polynomials in SymPy.jl I encountered segfaults when using Julia threads. MWE:

julia> using SymPy

julia> @syms a
(a,)

julia> p = sympy.Poly(a^2 + 3*a -2, a)
Poly(a**2 + 3*a - 2, a, domain='ZZ')

julia> for i in 0:2; @show p.coeff_monomial(a^i); end
p.coeff_monomial(a ^ i) = -2
p.coeff_monomial(a ^ i) = 3
p.coeff_monomial(a ^ i) = 1

julia> Threads.@threads for i in 0:2; @show p.coeff_monomial(a^i); end

signal (11): Segmentation fault
in expression starting at REPL[12]:1

signal (11): Segmentation fault
in expression starting at REPL[12]:1
PyObject_GC_Del at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_Malloc at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_GC_Malloc at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_GC_New at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyTraceBack_FromFrame at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
PyTraceBack_Here at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_FastCallDict at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_Call_Prepend at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
slot_tp_init at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
function_code_fastcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
type_call.lto_priv.242 at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_MakeTpCall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
function_code_fastcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_FastCall_Prepend at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
slot_tp_richcompare at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
PyObject_RichCompare at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
PyObject_RichCompareBool at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_FastCallDict at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_Call_Prepend at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
tuplerichcompare.lto_priv.211 at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
PyObject_RichCompare at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
slot_tp_init at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
function_code_fastcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
type_call.lto_priv.242 at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_MakeTpCall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
method_vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
function_code_fastcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_FastCallDict at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
method_vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyObject_Call_Prepend at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
PyVectorcall_Call at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
macro expansion at /home/goran/.julia/packages/PyCall/BD546/src/exception.jl:95 [inlined]
#107 at /home/goran/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:43 [inlined]
disable_sigint at ./c.jl:458 [inlined]
__pycall! at /home/goran/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:42 [inlined]
_pycall! at /home/goran/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:29
_pycall! at /home/goran/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:11
unknown function (ip: 0x7f8fd7194263)
_jl_invoke at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2237 [inlined]
jl_apply_generic at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2419
#_#114 at /home/goran/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:86
_jl_invoke at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2237 [inlined]
jl_apply_generic at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2419
slot_tp_init at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
jl_apply at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/julia.h:1703 [inlined]
do_apply at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/builtins.c:670
PyObject at /home/goran/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:86
_jl_invoke at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2237 [inlined]
jl_apply_generic at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2419
macro expansion at ./show.jl:955 [inlined]
macro expansion at ./REPL[12]:1 [inlined]
#21#threadsfor_fun at ./threadingconstructs.jl:81
#21#threadsfor_fun at ./threadingconstructs.jl:48
unknown function (ip: 0x7f8fd719616c)
_jl_invoke at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2237 [inlined]
type_call.lto_priv.242 at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
jl_apply_generic at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/gf.c:2419
_PyObject_MakeTpCall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
jl_apply at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/julia.h:1703 [inlined]
call_function at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
start_task at /buildworker/worker/package_linux64/build/src/task.c:839
_PyEval_EvalFrameDefault at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyEval_EvalCodeWithName at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
_PyFunction_Vectorcall at /home/goran/.julia/conda/3/lib/libpython3.8.so.1.0 (unknown line)
unknown function (ip: (nil))
Allocations: 9128275 (Pool: 9125487; Big: 2788); GC: 11
Segmentation fault

Is this only problematic with some functions or is SymPy.jl in general not threadsafe?

Ngôn ngữ chính: Julia
Star: 282
Fork: 59
Chỉ số merge pull request: Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của JuliaPy/SymPy.jl

Sympy.jl not working in newer versions of julia, in fedora 43
Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

JuliaPy/SymPy.jl#564 · 3 bình luận · Mở ngày 3/11/2025
`import_from` is gone. Still in docs
Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100

JuliaPy/SymPy.jl#563 · 3 bình luận · Mở ngày 20/4/2025
Not updated in registry
Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 35/100

JuliaPy/SymPy.jl#558 · 1 bình luận · Mở ngày 10/2/2025
very slow and memory problems after updating to v2
Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

JuliaPy/SymPy.jl#549 · 4 bình luận · Mở ngày 15/6/2024
SymPy v2 cannot be loaded in CI with Julia v1.6
Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

JuliaPy/SymPy.jl#539 · 2 bình luận · Mở ngày 24/11/2023

Tất cả issue của JuliaPy/SymPy.jl

Issue tương tự

Chains resumed from `initial_state` take `num_warmup + 1` warm-up steps
Có thể đã có người làm @thevolatilebit đã nhận hôm nay. Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 80/100

TuringLang/AbstractMCMC.jl#220 · Mở ngày 7/10/2026
perm_row of a uniform LU batch reports batch member 1 only
Đang mở
- Có gì không ổn?
found-by-agent

Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100

exanauts/SparseDirectSolver.jl#92 · Mở ngày 7/10/2026

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
resize! frees its new buffer with free instead of release
Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100

JuliaGPU/oneAPI.jl#667 · Mở ngày 7/10/2026

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
P3 lookup table data on CPU needs to be copied to GPU boundary condition data
Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 90/100

NumericalEarth/Breeze.jl#1051 · Mở ngày 6/10/2026

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
lu_instance/qr_instance run a full factorization for FixedSizeArrays
Có thể đã có người làm @devmotion đã nhận hôm nay. Đang mở
- Có gì không ổn?
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

JuliaArrays/ArrayInterface.jl#510 · Mở ngày 6/10/2026

Thêm issue về Julia

SymPy.jl not threadsafe?

Có gì không ổn?

Đánh giá

Hướng nghiên cứu

Mô tả

Chuẩn bị môi trường

Bắt đầu từ đâu

Issue khác của JuliaPy/SymPy.jl

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Issue tương tự

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Có gì không ổn?

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn