Segfault when plotting to axis of closed figure
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100
- Loại issue
- Lỗi
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Lĩnh vực
- data-visualization
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu bằng cách tái hiện tình huống figure đã đóng với PythonPlot v1.0.2 và ví dụ Julia trong issue. Sau đó kiểm tra phần xử lý GUI của PythonPlot quanh src/pygui.jl, dòng 199, cùng stack matplotlib/Tk được hiển thị trong trace. Được xem là hoàn tất khi việc plot vào một figure đã đóng không còn gây segmentation fault mà thay vào đó hoạt động an toàn, lý tưởng là phát sinh lỗi nếu thao tác này không được hỗ trợ.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
If we attempt to plot to the axis of a figure that has already been displayed and closed, then on my machine Juliaa segfaults.
julia> fig, ax = subplots() # opens plot window, leave open
Python: (<Figure size 640x480 with 1 Axes>, <Axes: >)
julia> ax.scatter(randn(10), randn(10)) # adds plot to window
Python: <matplotlib.collections.PathCollection object at 0x7f0df059df50>
Then close the opened plot window and run the following, which causes the segfault.
julia> ax.scatter(randn(10), randn(10))
Python: <matplotlib.collections.PathCollection object at 0x7f0df19db050>
julia>
[306116] signal (11.1): Segmentation fault
in expression starting at none:0
Tk_GetImageMasterData at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/lib-dynload/../../libtk8.6.so (unknown line)
Tk_FindPhoto at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/lib-dynload/../../libtk8.6.so (unknown line)
_ZL11mpl_tk_blitP7_objectS0_ at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/site-packages/matplotlib/backends/_tkagg.cpython-311-x86_64-linux-gnu.so (unknown line)
cfunction_call at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/methodobject.c:553
_PyObject_MakeTpCall at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/call.c:214
_PyEval_EvalFrameDefault at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:4774
_PyEval_EvalFrame at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Include/internal/pycore_ceval.h:73 [inlined]
_PyEval_Vector at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:6439 [inlined]
_PyFunction_Vectorcall at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/call.c:393
PythonCmd at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Modules/_tkinter.c:2252
TclNRRunCallbacks at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/lib-dynload/../../libtcl8.6.so (unknown line)
Tkapp_Call at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Modules/_tkinter.c:1462
method_vectorcall_VARARGS at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/descrobject.c:330
_PyObject_VectorcallTstate at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Include/internal/pycore_call.h:92 [inlined]
PyObject_Vectorcall at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/call.c:299
_PyEval_EvalFrameDefault at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:4774
_PyEval_EvalFrame at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Include/internal/pycore_ceval.h:73 [inlined]
_PyEval_Vector at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:6439 [inlined]
_PyFunction_Vectorcall at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/call.c:393
do_call_core at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:7357 [inlined]
_PyEval_EvalFrameDefault at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:5381
_PyEval_EvalFrame at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Include/internal/pycore_ceval.h:73 [inlined]
_PyEval_Vector at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:6439 [inlined]
_PyFunction_Vectorcall at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/call.c:393
do_call_core at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:7357 [inlined]
_PyEval_EvalFrameDefault at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:5381
_PyEval_EvalFrame at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Include/internal/pycore_ceval.h:73 [inlined]
_PyEval_Vector at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Python/ceval.c:6439 [inlined]
_PyFunction_Vectorcall at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/call.c:393 [inlined]
_PyObject_VectorcallTstate at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Include/internal/pycore_call.h:92
method_vectorcall at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/classobject.c:67
PythonCmd at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Modules/_tkinter.c:2252
TclNRRunCallbacks at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/lib-dynload/../../libtcl8.6.so (unknown line)
AfterProc at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/lib-dynload/../../libtcl8.6.so (unknown line)
TclServiceIdle at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/lib-dynload/../../libtcl8.6.so (unknown line)
Tcl_DoOneEvent at /tmp/jl_GaEsxY/.CondaPkg/env/lib/python3.11/lib-dynload/../../libtcl8.6.so (unknown line)
_tkinter_tkapp_dooneevent_impl at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Modules/_tkinter.c:2785 [inlined]
_tkinter_tkapp_dooneevent at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Modules/clinic/_tkinter.c.h:566
cfunction_vectorcall_FASTCALL at /usr/local/src/conda/python-3.11.4/Objects/methodobject.c:427
PyObject_CallObject at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonCall/qTEA1/src/cpython/pointers.jl:299 [inlined]
macro expansion at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonCall/qTEA1/src/Py.jl:131 [inlined]
pycallargs at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonCall/qTEA1/src/abstract/object.jl:210
unknown function (ip: 0x7f4b801c1ea6)
_jl_invoke at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2758 [inlined]
ijl_apply_generic at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2940
#pycall#59 at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonCall/qTEA1/src/abstract/object.jl:228
_jl_invoke at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2758 [inlined]
ijl_apply_generic at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2940
jl_apply at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/julia.h:1879 [inlined]
do_apply at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/builtins.c:730
pycall at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonCall/qTEA1/src/abstract/object.jl:218
_jl_invoke at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2758 [inlined]
ijl_apply_generic at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2940
jl_apply at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/julia.h:1879 [inlined]
do_apply at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/builtins.c:730
#_#11 at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonCall/qTEA1/src/Py.jl:341
_jl_invoke at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2758 [inlined]
ijl_apply_generic at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2940
jl_apply at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/julia.h:1879 [inlined]
do_apply at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/builtins.c:730
Py at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonCall/qTEA1/src/Py.jl:341
_jl_invoke at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2758 [inlined]
ijl_apply_generic at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2940
#9 at /home/sethaxen/.julia/packages/PythonPlot/f591M/src/pygui.jl:199
macro expansion at ./asyncevent.jl:281 [inlined]
#702 at ./task.jl:134
unknown function (ip: 0x7f4b801d59df)
_jl_invoke at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2758 [inlined]
ijl_apply_generic at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/gf.c:2940
jl_apply at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/julia.h:1879 [inlined]
start_task at /cache/build/default-amdci5-2/julialang/julia-release-1-dot-9/src/task.c:1092
Allocations: 10747647 (Pool: 10739903; Big: 7744); GC: 15
Segmentation fault (core dumped)
If plotting to this axis is not supported, it would be much better to throw an error.
Environment
julia> versioninfo()
Julia Version 1.9.2
Commit e4ee485e909 (2023-07-05 09:39 UTC)
Platform Info:
OS: Linux (x86_64-linux-gnu)
CPU: 8 × 11th Gen Intel(R) Core(TM) i5-1135G7 @ 2.40GHz
WORD_SIZE: 64
LIBM: libopenlibm
LLVM: libLLVM-14.0.6 (ORCJIT, tigerlake)
Threads: 8 on 8 virtual cores
Environment:
JULIA_CMDSTAN_HOME = /home/sethaxen/software/cmdstan/2.30.1/
JULIA_NUM_THREADS = auto
JULIA_EDITOR = code
(jl_jbDJBf) pkg> st
Status `/tmp/jl_jbDJBf/Project.toml`
[274fc56d] PythonPlot v1.0.2
- Ngôn ngữ chính
- Julia
- Star
- 85
- Fork
- 9
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của JuliaPy/PythonPlot.jl
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100
JuliaPy/PythonPlot.jl#55 · 3 bình luận ·
-
plots with missing and NaN dataĐang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
JuliaPy/PythonPlot.jl#54 ·
-
close(fig) broken for `subplots`Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
JuliaPy/PythonPlot.jl#53 ·
-
Độ khó 1/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 35/100
JuliaPy/PythonPlot.jl#52 · 2 reaction ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 20/100
JuliaPy/PythonPlot.jl#51 ·
Tất cả issue của JuliaPy/PythonPlot.jl
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
Sienna-Platform/PowerSystemCaseBuilder.jl#239 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
JuliaPluto/Malt.jl#114 ·
-
enhancement
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
QuantumSavory/QuantumSavory.jl#592 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
JuliaQUBO/QUBOTools.jl#136 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 80/100
Sienna-Platform/PowerFlows.jl#482 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày