Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

The Idea of Automated Fitting

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#1,676 2 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
5/5
Thời gian dự kiến
Hơn một tuần
Mức phù hợp với người mới
45/100
Loại issue
Tính năng
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Sôi nổi
Công nghệ
python
Lĩnh vực
backend, data

Hướng nghiên cứu

Start by reading the Bluesky callbacks documentation linked in the issue and reviewing the existing rscan and go peak workflow shown there. Define how multiple fitting options and post-scan results would support future plans, then verify that the mechanism is centrally available and satisfies both acceptance criteria.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

Currently GDA provides automated fitting for 1D datasets, and serves results to users to act upon. This is incredibly useful for alignment scans. It fits multiple options (see the image below, from left to right):

  1. One Gaussian to a scan: Used for aligning to the centre of something vaguely guassian shaped, here an imperfect top-hat. This can be used for determining the centre position of any multitude of objects.
  2. One Gaussian to the 1st derivative of a scan: Usually used for aligning to a knife edge scan, for example finding the edge of a slit or any other object with a hard edge.
  3. Two Gaussians to the 1st derivative of a scan: Usually used to find the middle of two edges something vaguely top-hat shaped. This can be used for aligning a number of things which have an inconsistent intensity across (a heterogeneous sample for instance), but have clear edges.
Image

The current use of this feature is by doing a scan, then requesting to move to a particular position:

rscan my_motor -5 5 1 my_detector
go peak

This is particularly useful for more complex (automated) fitting routines which are in regular use around the ring. Need to align your slits? That's a relatively stable process which takes 15 minutes, but you don't need there to be making the decisions about where your slit edge sits. You just need reliable fitting which your plan can act on.

There is a potential solution in bluesky, but currently I believe this implementation has drawbacks:

  1. It seems you can only fit one model at a time - not ideal if we're not sure if fit 1 or fit 3 will work better for us (usually this distinction is made by eye and by asking the question "Is my signal Gaussian enough for that Gaussian fit?")
  2. As far as I can tell, you need to provide a model and initial guess before you collect your signal (when you subscribe before the scan). I've found that even relatively good guesses for a perfect Gaussian (accurate position and sigma, but inaccurate intensities) will fail to find a fit completely. Not ideal for a generic scan when I may have decades of intensity differences across different detectors.

Perhaps this is a candidate for use with the new live-processing service, perhaps @RJCD-Diamond could comment on this?

Acceptance Criteria

  • There is a mechanism for automated alignment which allows users to action future plans based on these fitting results.
  • This mechanism is centrally available so at least the most-used fitting procedures don't need to be defined at each instrument.
Ngôn ngữ chính
Python
Star
13
Fork
14
Merge trung bình
6 ngày 15 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
14

Chuẩn bị môi trường

Mở trong Codespaces

Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của DiamondLightSource/blueapi

Tất cả issue của DiamondLightSource/blueapi

Issue tương tự

Thêm issue về Python

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.