nf-core/sarek

Tutorial: CNV calling

Aberta

#1.713 aberto em 30 de out. de 2024

Ver no GitHubGuia do colaborador
 (0 comentário) (0 reação) (0 responsável)Nextflow (539 forks)auto 404
enhancementhelp wanted

Métricas do repositório

Stars
 (589 estrelas)
Métricas de merge de PR
 (Mesclagem média 8d 10h) (17 fundiu PRs em 30d)

Description

Topic

CNVs analysis using Sarek

Tasks to realise the tutorial

  1. identify appropriate software
  2. simulate CNV data (max size 100Mb each)
  3. prepare gitpod / codespaces environment and build code
  4. prepare theoretical intro
  5. write down hands-on tutorial

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Siga a lista de tarefas: identifique o software apropriado para chamada de CNV, simule dados de CNV (máx. 100MB cada), prepare o ambiente Gitpod/Codespaces e construa o código, prepare uma introdução teórica e escreva um tutorial prático.
Pilha de tecnologia
None
Domain
data
Tipo Issue
Documentação
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
1
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
Meio dia
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Recente
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Claro
Prerequisites
Git
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
90