nf-core/deepvariant

Deepvariant Version

Aberta

#19 aberto em 17 de fev. de 2019

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 (17 comentários) (0 reação) (0 responsável)Nextflow (26 forks)auto 404
feature-requestgood first issue

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Description

@ewels Hello,

  1. Could you update the pipeline to 0.72 version?

  2. If i run it locally on my pc, will it use my acceleration cores of my GPU?

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Investigue onde a versão do DeepVariant está definida no pipeline Nextflow e como atualizá la. Considere a pergunta sobre o uso da GPU verificando o contêiner do DeepVariant e a configuração do pipeline para suporte a GPU.
Pilha de tecnologia
pythontensorflowdocker
Domain
datamachine learning
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
2
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-3 horas
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Ativo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Principalmente claro
Prerequisites
GitNextflowDocker
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
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