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addcyclic problem with grib2 data

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Avaliação

Dificuldade
3/5
Tempo estimado
1-2 dias
Facilidade para iniciantes
35/100
Tipo de issue
Bug
Clareza
Razoavelmente clara
Status de atividade
Estagnada
Stack de tecnologia
matplotlib, numpy, python
Domínio
data-visualization

Direção de pesquisa

Execute o script Python fornecido com as versões de Basemap especificadas e inspecione a chamada de addcyclic, seguida por Basemap.call e pela conversão de pyproj relatada. Compare as formas de temp, lons e lats antes e depois de addcyclic. A tarefa estará concluída quando o exemplo de GRIB2 for executado até o fim com arrays de coordenadas correspondentes e produzir o gráfico de contorno pretendido.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

I have some problems to use add cyclic with data from grib2 file.

This is my code:

# -*- coding: utf-8 -*-

import pygrib
import numpy as np

from matplotlib.backends.backend_agg import FigureCanvasAgg as FigureCanvas
from matplotlib.figure import Figure

from mpl_toolkits.basemap import Basemap, addcyclic

fig = Figure((4, 3))
canvas = FigureCanvas(fig)
ax = fig.add_axes([0.05, 0.05, 0.9, 0.9])

# File download from http://para.nomads.ncep.noaa.gov/pub/data/nccf/com/gfs/para/gfs.2016041918/gfs.t18z.pgrb2.0p25.f000
grbindx = pygrib.index('gfs.t18z.pgrb2.0p25.f000', 'shortName', 'typeOfLevel', 'level')
grb = grbindx.select(shortName='2t', typeOfLevel='heightAboveGround', level=2)[0]
lats, lons  = grb.latlons()
temp = grb.values

temp, lons = addcyclic(temp, lons)

bm = Basemap(projection='mill', resolution='l', ax=ax,
    llcrnrlat=32, urcrnrlat=70, llcrnrlon=-25,
    urcrnrlon=40.5, lat_ts=20)

x, y = bm(lons, lats)
bm.contourf(x, y, temp)

bm.drawcoastlines()

canvas.print_figure('gfs_temperature_2m.png', dpi=100)

With python 2.7.11 and basemap 1.0.7 this is the result:

Traceback (most recent call last):
  File "addcyclic.py", line 21, in <module>
    temp, lons = addcyclic(temp, lons)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/__init__.py", line 5062, in addcyclic
    lonsout[0:nlons] = lonsin[:]
ValueError: could not broadcast input array from shape (721,1440) into shape (1440)

With python 2.7.11 and basemap 1.0.8 (from latest github commit) this is the result:

Traceback (most recent call last):
  File "addcyclic.py", line 27, in <module>
    x, y = bm(lons, lats)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/__init__.py", line 1175, in __call__
    xout,yout = self.projtran(x,y,inverse=inverse)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/proj.py", line 286, in __call__
    outx,outy = self._proj4(x, y, inverse=inverse)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pyproj/__init__.py", line 399, in __call__
    _proj.Proj._fwd(self, inx, iny, radians=radians, errcheck=errcheck)
  File "_proj.pyx", line 128, in _proj.Proj._fwd (_proj.c:1678)
RuntimeError: Buffer lengths not the same

Where is the problem?
Some bug in basemap? Or in my code?

Without addcycle this is the result:
gfs_temperature_2m

Thanks
Andrew

Linguagem predominante
Python
Estrelas
817
Forks
395
Nenhum PR com merge em 30d

Preparar o ambiente

Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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