Error when importing Python modules in Package namespace

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Avaliação

Dificuldade
4/5
Tempo estimado
3-5 dias
Facilidade para iniciantes
38/100
Tipo de issue
Bug
Clareza
Razoavelmente clara
Status de atividade
Estagnada
Stack de tecnologia
julia, python
Domínio
backend

Direção de pesquisa

Comece com o exemplo MyPkg.jl, o uso de pyimport do PyCall e o stack trace em PyCall.jl:299-318. Reproduza a diferença entre MyPkg.my_code, MyPkg.my_code2 e include("/MyPkg.jl") em um notebook Jupyter e, em seguida, investigue o comportamento de pré-compilação relatado. Considera-se concluído quando o import em nível de pacote funciona ao carregar o pacote instalado, com um teste de regressão cobrindo o caso que falha.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

Hi,

I'm trying to write a standalone package that uses PyCall. I thought importing Python modules only once into the global namespace of the package MyPackage would be beneficial for performance. This works when executed in a Jupyter notebook, but not in a separate package.

Here is the code of the package MyPackage:

module MyPkg

using PyCall
np = pyimport("numpy")


function my_code(a)
    return np.mean(a)
end


function my_code2(a)
    np = pyimport("numpy")
    return np.mean(a)
end


end

Install the package and then execute the following in a Jupyter notebook:

using MyPkg

MyPkg.my_code([1., 2.])

Error message:

ArgumentError: ref of NULL PyObject

Stacktrace:
 [1] _getproperty(o::PyCall.PyObject, s::Symbol)
   @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/ygXW2/src/PyCall.jl:299
 [2] __getproperty
   @ ~/.julia/packages/PyCall/ygXW2/src/PyCall.jl:312 [inlined]
 [3] getproperty(o::PyCall.PyObject, s::Symbol)
   @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/ygXW2/src/PyCall.jl:318
 [4] my_code(a::Vector{Float64})
   @ MyPkg ~/.julia/packages/MyPkg/3Tsby/src/MyPkg.jl:9
 [5] top-level scope
   @ In[3]:1
 [6] eval
   @ ./boot.jl:368 [inlined]
 [7] include_string(mapexpr::typeof(REPL.softscope), mod::Module, code::String, filename::String)
   @ Base ./loading.jl:1428

However, this works:

using MyPkg

MyPkg.my_code2([1., 2.])

This also works:

include("<path>/MyPkg.jl")
MyPkg.my_code([1., 2.])

I suspect that the precompilation is somehow interfering, but I know far too little about how imports work in Julia or how PyCall works to be sure.

Linguagem predominante
Julia
Estrelas
1.5k
Forks
186
Merge médio
7d 10h
PRs com merge (30d)
2

Preparar o ambiente

Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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