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Option to deflate TRX files created with Python

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評価

難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
初心者へのやさしさ
45/100
issue の種類
機能追加
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
停滞
技術スタック
python
領域
cli

調査の方向性

tff_convert_tractogram.py から始め、既存の --positions_dtype と --offsets_dtype オプションを使って、TRX ZIP ファイルが作成される場所を特定します。Python の zipfile の圧縮オプションと、issue の zip2zip.py の例を確認します。ツールが設定可能なレベルで stored または deflate 圧縮を選択でき、既存の動作を維持できれば完了です。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

I find the tff_convert_tractogram.py tool useful, and it provides options for both --positions_dtype and --offsets_dtype. However, the TRX zip files are always uncompressed (store) rather than using compression (some level of deflate). It might be nice to trade off file creation speed with file size (and transmission time).

I did write a little Python script to do this, but it would be nice to integrate this. My standalone script allows you to recompress any zip file (including trx) with a desired compression level:

python zip2zip.py -c 9 IFOF_L32.trx IFOF_L32_z9.trx

The code is:

import zipfile
import argparse
import sys

def recompress_zip(input_zip: str, output_zip: str, compression_level: int):
    """Recompress a ZIP file with a specified compression level (0-9)."""
    compression_type = zipfile.ZIP_DEFLATED if compression_level > 0 else zipfile.ZIP_STORED

    with zipfile.ZipFile(input_zip, 'r') as src_zip:
        with zipfile.ZipFile(output_zip, 'w', compression=compression_type, compresslevel=compression_level) as dst_zip:
            for file_info in src_zip.infolist():
                with src_zip.open(file_info.filename, 'r') as src_file:
                    dst_zip.writestr(file_info, src_file.read(), compress_type=compression_type)
    
    print(f"Recompressed {input_zip} -> {output_zip} with compression level {compression_level}")

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description="Recompress a ZIP file with a specified compression level.")
    parser.add_argument("input_zip", help="Path to the input ZIP file")
    parser.add_argument("output_zip", help="Path to the output compressed ZIP file")
    parser.add_argument("-c", "--compression", type=int, choices=range(0, 10), default=9, 
                        help="Compression level (0-9, where 0 is uncompressed and 9 is max compression, default: 9)")
    
    args = parser.parse_args()
    
    try:
        recompress_zip(args.input_zip, args.output_zip, args.compression)
    except Exception as e:
        print(f"Error: {e}", file=sys.stderr)
        sys.exit(1)

if __name__ == "__main__":
    main()
主要言語
Python
スター
27
フォーク
20
平均マージ
1日 14分
マージ済み PR（30日）
2

環境構築

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