MPI generated quantities
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評価
調査の方向性
まず、既存の sample_mpi メソッドと generated_quantities を比較し、fitted_params が MPI 設定をどのように記録しているかを調べます。専用の generated_quantities_mpi エントリポイントと MPI の自動検出のどちらが適切かを判断し、その後、generated quantities が要求された MPI コマンドと引数で実行されることを検証します。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Similar to sample_mpi method it make sense to have generated_quantities_mpi that is able to run the block with MPI. An alternative could be to have generated_quantities detect if the fitted_param is based on MPI run, if so it performs MPI run on the block. That is,
generate_quantities_mpi(
fitted_params,
mpi_cmd = "mpiexec", # use mpi
mpi_args = NULL, # use mpi
data = NULL,
seed = NULL,
output_dir = NULL,
sig_figs = NULL,
parallel_chains = getOption("mc.cores", 1),
threads_per_chain = NULL
)
or
generate_quantities(
fitted_params,
use_mpi_from_fitted_params = TRUE, # use mpi settings from fitted_params
data = NULL,
seed = NULL,
output_dir = NULL,
sig_figs = NULL,
parallel_chains = getOption("mc.cores", 1),
threads_per_chain = NULL
)
- 主要言語
- R
- スター
- 164
- フォーク
- 69
- 平均マージ
- 1日 9時間
- マージ済み PR（30日）
- 48
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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